这篇文章很长，超过1万字，是本系列中最重要的一篇，因为我并非只是在简单地告诉大家几条硬邦邦的操作命令。对于新手而言不建议碎片时间阅读，对于有一定...
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从零开始完整学习全基因组测序（WGS）数据分析：第4节 构建WGS主流程 -
从零开始完整学习全基因组测序（WGS）数据分析：第2节 FASTA和FASTQ在WGS数据的分析过程中，我们会接触到许多生物信息学/基因组学领域所特有的数据文件和它们特殊的格式，在这一节中将要介绍的FASTA和FASTQ便...
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从零开始完整学习全基因组测序（WGS）数据分析：第1节 DNA测序技术前言 基因测序已是时下热门，目前除了华大基因之外，其他分布于全中国的大型测序平台（HiSeq X 10）还有约10个，每个每年大概能完成1.8万...
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生信笔记收藏汇总
更新日期：2018/3/13 这里汇总一些生信分析和数据可视化相关的推文或笔记，为知笔记里存的东西太杂太乱，花了一天的时间初步整理了下。点击跳转...
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RNAseq 必读综述和在线教程最近读到一篇博文，介绍了学习 RNAseq 数据分析非常推荐的两篇综述和七个在线教程并发表了相关评论。本文将进行简要整理并对相关评论内容进行大致...
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测序数据基本信息统计 | reads,coverage,depth
00 写在前面 测序后公司交付数据时，一般会提供质控后的clean data和后续的基础分析结果。因为可能需要自己来进行数据的预处理，记得一定要...
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RNA-seq分析的流程及软件前言：观看B站孟浩巍的系列视频2017-08-04-高通量测序技术交流录像，内容颇多，直接记录笔记代码，没有经过本地运行，仅作记录，他日再做梳理...
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GATK4.0和全基因组数据分析实践（上）前言 在前面的一系列WGS文章中，我讲述了很多基因数据分析的来龙去脉，虽然许多同学觉得很有帮助，但是却缺了一个重要的环节——没有提供实际可用的数...
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GATK4全基因组数据分析最佳实践,我以这篇文章为标志,终结当前WGS系列数据分析的流程主体问题 | 完全代码这是我根据之前的WGS系列和GATK4实践文章进行重新梳理之后确定下来的分析流程，这是一个WGS的最佳实践，它基于GATK4和我的实际经验，稍作...
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在线RNA-seq可视化网站-目前见过最流弊的（多图慎点）先丢链接http://bioinformatics.sdstate.edu/idep/ 能做什么？可视化见过最全的的在线RNA-seq分析，把这...
专题公告
包括WGS, WES, RNA-seq, ATAC-seq, 甲基化等
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