在做单细胞分析时，无论是用monocle3还是2，都会出现各种各样的问题，记录一下解决过程 monocle3： 问题1 在用 和 时，会遇到和 leiden相关的问题。 解决...
IP属地：福建
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monocle中遇到的问题
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不看私信<br>看不到的文章是被简书锁了
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单细胞加权基因共表达网络分析scWGCNA-01scWGCNA是一个生物信息学工作流程，是R包WGCNA[https://horvath.genetics.ucla.edu/html/CoexpressionNetwork...
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不做无条件咨询，见谅
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R: ggtree (四) ggtreeExtra本文整理至ggtreeExtra文档，仅用于学习 作者：Shuangbin Xu and GuangChuang Yu链接：https://bioconductor.org/...
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个人wx公众号：木舟笔记。
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【r<-包】ComplexHeatmap（4）：热图注释Author: Zuguang Gu ( z.gu@dkfz.de )翻译：诗翔Date: 2018-10-30 图形注释非常常用。热图注释唯一相同的特征是它们对齐热图的列或...
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网络配置错误
我很长时间不配置网络的东西，今天我在网上搜了一个配置ip页面，配置的时候出现了错误，我是这么一步步错的 首先，我的系统是centos7 1.我先复制了配置IP的文件了 # c...
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个人学习笔记，网上都能找到，仅是自己学习相关的记录
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RNA-seq学习：No.7IsoformSwitchAnalyzeR包（1）IsoformSwitchAnalyzeR包是2019年才发布的一个分析包，更充分地发挥了RNA-seq数据的价值。学习笔记参考官方文档，示例文件参考R包内嵌数据；回校后再利...
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太棒了👍
RNA-seq学习：No.8IsoformSwitchAnalyzeR包（2）
在之前的步骤中，已经筛选出感兴趣的转录本信息，并添加了多种注释了。接下来就可以做最后的分析了，比如哪个基因的转录本信息变化最大，如何变化。由于之前的示例文件包含基因数比较少，...
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RNA-seq学习：No.8IsoformSwitchAnalyzeR包（2）在之前的步骤中，已经筛选出感兴趣的转录本信息，并添加了多种注释了。接下来就可以做最后的分析了，比如哪个基因的转录本信息变化最大，如何变化。由于之前的示例文件包含基因数比较少，...
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努力努力再努力~<br>个人博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Flishensuo.github.io%2F" target="_blank">https://lishensuo.github.io/</a>
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RcisTarget || 从基因列表到调控网络单细胞技术正在加强我们对细胞本身的理解。什么是细胞类型，不就是基因选择性表达的结果吗？而基因的选择表达受到一系列的转录调控，在这个意义上，细胞命运背后的驱动力在于各自转录因子...
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计算生物学、统计学、机器学习<br>
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2019.8月中旬开始系统自学生信，<br>自学路漫漫索性报个班。<br><br>生信技能树真的很棒！<br><br>这是我的一个学习笔记平台，点滴记录。
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关于 ChIPseeker 注释转录因子 Peak 的一点思考个人观点：将 ignoreDownstream 和 ignoreUpstream 的结果取并集更好的能代表 TF 结合的靶基因启动子区？？希望明天服务器早点恢复，看另外一个结...
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ChIPseeker的upsetplot是怎么写的在距今2年前的一个日子里，我写了一篇关于upsetR的简单教程。两年过去了，这篇教程是百度搜索的第一位。 在这篇教程中，我定了一个计划 下一期写一篇Y叔的upsetplot是...
