你好，我做的是某个属内的种间差异，然后某个种的PGAwarning提示rps19内含子里有终止子，该基因未注释出来，同样geneious也未注释出来，同参考相比呢就缺失这个基因，要怎么将这个基因的注释添加上去呢？之前属内其它种注释没出现这个情况呢 ，知道的话可否告知，谢谢了😃
叶绿体基因组注释软件PGA使用说明PGA-Plastid Genome Annotator[https://github.com/quxiaojian/PGA] Qu X-J, Moore MJ, Li D-...
@wangsb_2020 脚本运行Raxml可以设置外类群吗 怎么弄呢
使用modeltest-ng和raxml-ng构建ML系统发育树虽然简单，但绝对首发……该给自己的系统发育构建流程升级了，新版本软件不仅速度快，而且对用户友好！ modeltest-ng 的速度是真的飞快！modeltest-ng 和 r...
@bettermaan 可以具体问一下操作步骤吗 我用mafft比对之后，RAXML脚本建树，出现某条序列中存在标点，不知道怎么该，fasta文件用于建树的。
三种方法构建系统发育树 学习笔记所用数据为一个属内不同种不同群体的叶绿体基因组序列，数量为80条。 发现用全长序列建树的时候，不适合选用太多外类群，否则ML法中会导致属内分枝的枝长特别短。原因应该是基因间隔...
我的分析数据和你的类似，请问ML你采用了哪种软件？
😊
三种方法构建系统发育树 学习笔记所用数据为一个属内不同种不同群体的叶绿体基因组序列，数量为80条。 发现用全长序列建树的时候，不适合选用太多外类群，否则ML法中会导致属内分枝的枝长特别短。原因应该是基因间隔...
paup运行添加模型的nex文件，一致跑不出来是否是paup软件问题，后续提示error
Mrmodeltest和paup不关联
使用MrBayes软件构建系统发育树的一个小实例本文的内容主要参考文章 《系统发育分析之BI篇（By Raindy）》 本次实例所用到的数据为8个苹果属植物完整的叶绿体基因组序列加一个 Aphananthe aspera（...
构建全基因组的MLtree可以用你的命令吗 你的是girhub下载下来装在ubuntu了吗
使用modeltest-ng和raxml-ng构建ML系统发育树虽然简单，但绝对首发……该给自己的系统发育构建流程升级了，新版本软件不仅速度快，而且对用户友好！ modeltest-ng 的速度是真的飞快！modeltest-ng 和 r...
@牧羊的男孩儿 好的 那你试过Dnasp 做sliding window 分析吗 我想问一下操作步骤
读文章重复结果：使用DnaSp软件计算核苷酸多态性Pi(nucleotide diversity)叶绿体基因组的文章中通常会有一小部分内容是运用DnaSp软件来进行核苷酸多态性π分析，断断续续看了也好长时间了，今天终于重复出了结果，简单记录自己的重复过程： 论文：comp...
请问如何将多条序列导入进行一起比对 导入一条会提示无法DNA Polymorphism
读文章重复结果：使用DnaSp软件计算核苷酸多态性Pi(nucleotide diversity)叶绿体基因组的文章中通常会有一小部分内容是运用DnaSp软件来进行核苷酸多态性π分析，断断续续看了也好长时间了，今天终于重复出了结果，简单记录自己的重复过程： 论文：comp...
