IP属地:上海
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关于为何要进行SNP的过滤: 第一,低质量和无信息的SNP会影响后续群体结构或GWAS的分析结果,甚至影响后续对生物学问题的解释;第二,群体研究...
所用数据为一个属内不同种不同群体的叶绿体基因组序列,数量为80条。 发现用全长序列建树的时候,不适合选用太多外类群,否则ML法中会导致属内分枝的...
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文本处理 Shell脚本编程 Shell 十三问 学习笔记 shell and Carriage 关系 Shell会依据IFS(Internal...
1基本命令 2 外部数据导入导出 3 中级变量操作 4 热图 5 选取差异明显的基因的表达量矩阵绘热图 6 id转换 7和8 9 表达矩阵的样本...
sra文件地址:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/ 下载测序...
首先下载juicer后,另建一个juicer-work的文件夹,juicer-work里面各个文件夹的位置要放对,reference, fast...
网上有很多其他做survey的教程,有的还很详细,但大多都很老了,感觉对现在来说并不适用,所以总结出我觉得现在比较好的一个方法吧。 总共只需两个...