最近一篇NG中使用到的软件,用来去除冗余的contigs,现简单记录。 CD-HIT早先是一个蛋白聚类的软件,其主要的特定就是快!(ps:不是所有快的都是好的) 其去除冗余序...
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最近一篇NG中使用到的软件,用来去除冗余的contigs,现简单记录。 CD-HIT早先是一个蛋白聚类的软件,其主要的特定就是快!(ps:不是所有快的都是好的) 其去除冗余序...
cd-hit是用于蛋白质序列或核酸序列聚类的工具,根据序列的相似度对序列进行聚类以去除冗余的序列,一般用于构建非冗余的数据集用于后续的实验分析。 cd-hit聚类算法 通常来...
号外!!! 在这周我会推出实战用snippy构建系统进化树的视频,我会拿出11个沙门菌进行聚类分析!!!!!!!!! vcf (Variant Call Format)是一种...
MUMmer 4 是一个快速比对 DNA 或蛋白序列的软件,最常用的 program 就是 nucmer 和 promer,分别是比对核苷酸和氨基酸序列的,接下来以 nucm...
DeepVariant安装 官方首推用docker装,没有root权限装个锤子;然后是从源码装,源码是基于Ubuntu的,我用的是CentOS;实在不行就用二进制文件装,我菜...
写在前面的话 今天是2021年1月3号,年底一番瞎忙活,停更了好长一段时间的简书。人生中有个很重要伯乐导师告诉我,在这个事多的工作环境下,没人愿意看你太多的废话。直奔重点才是...