@XiongApple 可以cor.test()
【R语言编程】---根据表达量计算mRNA与lncRNA的皮尔森相关系数前言:在构建ceRNA 网络时,需要计算lncRNA 与 蛋白编码gene (pc gene) 间的表达相关性,一般采用皮尔逊相关系数。具体如何做呢? 首先获得lncRNA...
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【R语言编程】---根据表达量计算mRNA与lncRNA的皮尔森相关系数前言:在构建ceRNA 网络时,需要计算lncRNA 与 蛋白编码gene (pc gene) 间的表达相关性,一般采用皮尔逊相关系数。具体如何做呢? 首先获得lncRNA...
如果lncrna和mrna不在同一数据集中,样本量不同该怎么办
【R语言编程】---根据表达量计算mRNA与lncRNA的皮尔森相关系数前言:在构建ceRNA 网络时,需要计算lncRNA 与 蛋白编码gene (pc gene) 间的表达相关性,一般采用皮尔逊相关系数。具体如何做呢? 首先获得lncRNA...
一、miRNA的一般研究策略 miRNA也称微RNA、microRNA,是真核生物中广泛存在的一种长度为21-23nt的RNA分子,可通过与mRNA的结合,抑制mRNA的转录...
转录组测序的最直接目的,就是设法寻找组间显著表达变化的基因,解释基因表达水平的变化对生物功能的影响。例如,肿瘤患者与正常人群相比哪些编码蛋白或非编码RNA分子发生了失调,这些...
一文看懂PCA主成分分析中介绍了PCA分析的原理和分析的意义(基本简介如下,更多见博客),今天就用数据来实际操练一下。 在生信宝典公众号后台回复“PCA实战”,获取测试数据。...
@NiKasu 好的,学到了,感谢大佬
12.GEO数据集的R语言差异分析和代码解析—1.数据下载和整理一、举例介绍 本节下载GSE1009数据集,使用limma包进行差异分析举例。 GSE1009 样本量:共6个样本,其中3个为糖尿病肾病(DN)肾小球样本,另3个为正常肾小球...
一、举例回顾 本节下载GSE1009数据集,使用limma包进行差异分析举例。 GSE1009 样本量:共6个样本,其中后3个为糖尿病肾病(DN)肾小球样本,前3个为正常肾小...