cor函数无法计算P值,有没有可以计算P值的函数,谢谢各位
【R语言编程】---根据表达量计算mRNA与lncRNA的皮尔森相关系数前言:在构建ceRNA 网络时,需要计算lncRNA 与 蛋白编码gene (pc gene) 间的表达相关性,一般采用皮尔逊相关系数。具体如何做呢? 首先获得lncRNA...
cor函数无法计算P值,有没有可以计算P值的函数,谢谢各位
【R语言编程】---根据表达量计算mRNA与lncRNA的皮尔森相关系数前言:在构建ceRNA 网络时,需要计算lncRNA 与 蛋白编码gene (pc gene) 间的表达相关性,一般采用皮尔逊相关系数。具体如何做呢? 首先获得lncRNA...
您好,pvalueCutoff值感觉是根据p.adj截取的呢
GEO数据挖掘小尝试:(三)利用clusterProfiler进行富集分析clusterProfiler 是业界大神Y叔写的一个R包,可以用来做各种富集分析,如GO、KEGG、DO(Disease Ontology analysis)、Reacto...
您好,我是初学者,目前也在做lncRNA测序数据分析,想咨询一下采用gffcompare分类之后生成6个文件,采用哪一个文件进行后面的lncRNA鉴定呢?谢谢您
拟南芥长链非编码RNA(lncRNA)鉴定的一个简单小例子链特异性文库数据对应的论文 Identification and characterization of novel lncRNAs in Arabidopsis thali...
您好,我采用gffcompare分类的,获得的tmap文件中FPKM和TPM值都为0,您知道是什么原因吗?谢谢
lncRNA数据处理(get fasta>>>novel lncRNA)))情况说明:我有两个实验,每个实验两个重复,我现在要鉴定到新的lncRNA之后进行差异分析。大体思路,我会先通过常规的鉴定novel lncRNA方法鉴定到新的转录本,将转录本...