SilviaKan

虽然简单，但绝对首发……该给自己的系统发育构建流程升级了，新版本软件不仅速度快，而且对用户友好！ modeltest-ng 的速度是真的飞快！modeltest-ng 和 r...

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前言 很多关注我这个专题的朋友都在后台留言，说想了解更多关于SNP过滤的东西。是的，确实这是一个比较重要的问题。第一，过滤到一些低质量的SNP可以防止calling一些假阳性...

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在群体遗传学研究中，LD连锁不平衡分析是最常见的分析内容，也是关联分析的基础。如何正确理解并且进行相关的LD连锁不平衡分析是群体遗传中很基本的一件事情。下面和大家一起学习一下...

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Tajima's D - Wikipedia[https://en.wikipedia.org/wiki/Tajima%27s_D] Tajima's D是由日本研究员田田文...

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请问您服务器上包含vcfutils.pl的samtools是什么版本呀 我的老是报错

PSMC 分析

参考路径： /public/home/yangjie/hudie/Pb_project/04.evolution/06.psmc/02.psmc/test4/bootstra...

译文达练

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SilviaKan

您好 请教一下我再运行vcfutils.pl vcf2fq -d 10 -D 50 populations.snps.vcf > tmp.fq这一步的时候，有以下报错：Use of uninitialized value $q in numeric lt (<) at /usr/local/bin/vcfutils.pl line 529, <> line 77031.
Use of uninitialized value $q in addition (+) at /usr/local/bin/vcfutils.pl line 539, <> line 77031.###不知道是什么情况？

PSMC 分析

参考路径： /public/home/yangjie/hudie/Pb_project/04.evolution/06.psmc/02.psmc/test4/bootstra...

译文达练

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SilviaKan

作者你好，我在其他文章中看到只有重测序数据能进行种群动态分析，我做的是ddRAD-seq，可以做这个么 ？所有的coverage 都能达到8X 大部分能达到10X

群体进化-GWAS分析

群体进化-gwas分析 群体进化基础分析 PCA 分析原理PCA(Principal Component Analysis)，即主成分分析方法，是一种使用最广泛的数据...

点滴生信

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SilviaKan

课后练习 第一题 Write a program that acts like cat, but reverses the order of the output lines...

SilviaKan

读文献是每个科研工作者的必修课。无论你是科研小白，你需要通过读文献来入门你所感兴趣的领域。又或者你是学有所成领域内的专家，也要通过读文献来了解领域内的最新发现来修炼内功，扩充...

SilviaKan

简单的记录了书里的小例子，以及章节后的练习题的脚本。 If Control Structure（IF循环） 脚本如下： While Control Structure（Whi...