研究生在读，植物病原真菌致病基因功能解析&生信分析~欢迎相互交流，共同进步。
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BLAST（序列相似性快速搜索工具）1. 什么是BLAST？ BLAST的全称是Basic Local Alignment Search Tool（基本的局部比对搜索工具），基于一种局部最优的比对策略。 BLA...
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分子进化笔记（四）: MEGA5构建系统发育树本文转载自http://blog.sina.com.cn/s/blog_5eb2fefb0101gny0.html 1．准备序列文件 准备fasta格式序列文件（fasta格...
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Transcript ID（ENST/ENSMUST/NM_123456）转换为gene ID（ENSG/ENSMUSG/Gene ID）和Gene name/Symbol----前不久拿到公司给的转录组测序结果，Gene ID是以ENMUST开头，查了一下，ENST为EMBL 核酸数据库中人类的转录本ID，ENMUST为鼠的转录本ID。一般我...
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使用SMART预测新型冠状病毒2019-nCoV的结构
欢迎来到"bio生物信息"的世界 有很多的工具可以预测蛋白质结构，比如我之前写过的三篇文章： 1）蛋白质结构模型和功能预测：Swiss-model工具的使用：https://...
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生信 SMART --使用介绍SMART 简介----蛋白序列功能域分析 simple modular architecture research tool Smart官网：http://smart.em...
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<br>自学生信的小白，<br>生物届的一只单身狗!<br><br>从爬虫过来的蛇友！
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前言科学-3D2Y<br><br>简书博客<br><a href="http://www.jianshu.com/u/599a9e91afc8" rel="nofollow" target="_blank">http://www.jianshu.com/u/599a9e91afc8</a><br><br>CSDN博客<br><a href="https://blog.csdn.net/leadingsci" rel="nofollow" target="_blank">https://blog.csdn.net/leadingsci</a><br><br>微店：<br><a href="https://weidian.com/?userid=583316993&wfr=wx_profile" rel="nofollow" target="_blank">https://weidian.com/?userid=583316993&wfr=wx_profile</a>
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蛋白质三维结构预测、结果解读与评分蛋白质三维结构预测，只要有目的基因的氨基酸序列就可以做，不限物种，没有太多要求，可为文章增色。windows版本的VMD软件可在公众号生信星球回复“VMD”获得，且附带软件中...
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5️⃣ 蛋白质序列基本和特征信息分析(1) :蛋白质序列基本信息分析(氨基酸组成，理化性质，亲疏水等)[序列比对和序列特征分析总目录](https://www.jianshu.com/p/878f2b2495ae 蛋白质是生命功能的执行者，一切生命活动都与蛋白质有关。我们知道...
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生物数据库
生物数据库 基本序列格式 1.FASTA格式：首行为描述行，以>为起始，其后为描述信息；第二行即为原始序列。2.FASTQ格式:FASTQ格式包括四部分信息：第一行为包含序列...
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在线预测蛋白质结构预测蛋白质结构PyMOL 蛋白质是生命活动的体现者，其结构决定着功能。由线性氨基酸组成的蛋白质需要折叠成特定的空间结构才具有相应的生理活性和生物学功能。 解析蛋白质的空间结构...
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蛋白质结构分析一点小心得这几天忙着写一个前列腺癌蛋白标记相关的小报告，恶补前列腺癌相关的知识和这个蛋白特性，学找分析这个蛋白质的特性（包括分子量、等电点、氨基酸组成、跨膜域、信号肽、疏水性和结构功能...
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生物信息学数据库及在线工具汇总 （更新）
核酸数据库 NCBI [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/]NCBI (National Center for Biotechnolo...
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构建系统发育树
系统发育树的构建 现有的方法 系统发育树构建方法的优劣 link 选择：一般情况下，若有合适的分子进化模型可供选择，用最大似然法构树获得的结果较好；对于近缘物种序列，通常情况...
