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R实用基础1——基本设置与操作整理一下刚接触R时碰过无数次壁后记录的一些笔记，行行笔记都是泪(Ｔ▽Ｔ) 1、Rstudio常用的快捷键 修改补充自 Rstudio 中常见的快捷键[https://blog...
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1.GWAS：原理与目的全基因组关联分析（Genome-Wide Association Study， GWAS）是以连锁不平衡（LD）为基础，利用全基因组范围内群体中高密度的分子标记，鉴定与复杂性...
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WGCNA学习：WGCNA分析原理本教程根据PlantTech的WGCNA课程编写，课程还是不错的，所以将该课程给大家分享一下。 WGCNA笔记第一弹 WGCNA分析原理 WGCNA应用场景 WGCNA分析实...
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WGCNA原理和分析流程WGCNA全称weighted gene co-expression network analysis，即加权基因共表达网络分析。它是一种分析多个样本基因表达模式的分析方法，...
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部分WGCNA的blockwiseModules参数解释
我们的表达数据， 多组格式的表达式数据（见checkSets）。一个列表的向量，每组一个。每个集合必须包含一个包含表达数据的数据，行对应于样本，列对应于基因或探针。 该检查数...
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跟着Nature Communications学作图 -- 复杂百分比柱状图从这个系列开始，师兄就带着大家从各大顶级期刊中的Figuer入手，从仿照别人的作图风格到最后实现自己游刃有余的套用在自己的分析数据上！这一系列绝对是高质量！还不赶紧点赞+在看...
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使用GPT让你的RStudio如虎添翼
API的的调用目前来说不限制地区，但是OpenAI的API的申请限制了地区。运行的时候，如果出现了429，意味着你被限流了，需要等一会才行。 前提是，你需要注册一个OpenA...
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【陪你学·R语言绘图】学术图表介绍本想着写一篇介绍论文中各种类型图表的推送，但是着笔介绍时又觉得不如一起绘图吧！各类学术图表都万变不离其宗，以图的形式将处理后的数据展示出来（主要指的是数据展示图，还有实验拍摄...
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一句代码同时运行多组富集分析传统的富集分析的步骤是： 计算出差异表达基因列表 运行GO 运行KEGG当然，也可以运行其他富集分析，比如DO，Wikipathways或者Reactome等等，然后再可视化...
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GSEA富集分析+R分析+多类美化工具相关原理详细介绍生信技能树详解GSEA[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&mid=2247507922&id...
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构建自己的R包--KEGG.db
参考地址在使用clusterProfiler时，KEGG注释包，可以自定义。毕竟许多物种的数据库是不完善的。现在就自定义一个KEGG.db的包，用于KEGG注释。 简单快捷方...
