图片今天上传不了,改天加上。 1.组装后Contig基因组过滤污染或线粒体质体 文献来源:异源四倍体早熟禾:https://doi.org/10.1093/g3journal...
图片今天上传不了,改天加上。 1.组装后Contig基因组过滤污染或线粒体质体 文献来源:异源四倍体早熟禾:https://doi.org/10.1093/g3journal...
应该是第一列必须是###开始。你要把前面EDTA产生的那些注释删了
LTR插入时间估算本文方法是根据"Ageing LTR insertions"(https://github.com/SIWLab/Lab_Info/wiki/Ageing-LTR-inser...
写在前面 午间,收到朋友求助,问及如何进行序列的 KOG 注释...Emmm,这个可就太久远了。事实上,无论是 COG 还是 KOG 数据库,基本都没怎么更新过。其中 KOG...
注意:今天的教程比较长,请规划好你的时间。本文是付费内容,在本文文末有本教程的全部的代码和示例数据。 输出结果 分析代码 关于WGCNA分析,如果你的数据量较大,建议使用服务...
本文主要工作:(1) 按前期处理凤梨所需分析数据下载并处理拟南芥分析数据(2) 对拟南芥和凤梨 SBT基因家族cds序列进行比对,并构建进化树文件 3.序列比对与进化树构建 ...
启动子 启动子是RNA 聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA 序列,它含有RNA 聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列,多数位于结构基因转录起始点的上游,启动子本身不被...
目录关于 Falcon部件介绍组装流程Connection within HGAP4 vs falcon vs falcon-unzip安装及测试数据下载试运行最后 很多公众...
--关于WGNCA的教程,本次的共有三期教程,我们同时做了三个分析的比较,差异性相对还是比较大的,详情可看WGCNA分析 | 你的数据结果真的是准确的吗??[https://...
以前做序列比对通常都是MEGA来做,然后有时候会用genedoc来展示,但是经常碰到一个问题就是没办法得到矢量图。所以一直在想用R能不能展示多序列比对的结果,尤其是核心关键d...
Hi-C 技术原理 Hi-C是染色质区域捕获(Chromosome conformation capture)与高通量测序(High-throughput sequencin...
今天开启重测序分析专题啦!恳请各位观众老爷点点关注! 所有分析均在linux系统上完成整个重测序分析流程涉及到的软件非常多,本节介绍重测序常用软件的安装方法。 安装R包 使用...
首先查到了一个软件是 Cutadapt https://cutadapt.readthedocs.io/en/stable/[https://cutadapt.readthe...
之前使用的是3D-DNA流程做Hi-C的辅助组装,它的最大优势就是输出结果可以对接下游的JBAT(juicerbox with Assembly Tools)进行手动矫正。然...