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R语言相关性分析步骤到底怎么组合？
用原始表型获得相关性系数的矩阵数据的话，则可以使用psych包的corr.test函数。导入数据，注意不要表头不要在里面，不然不能识别，而且不能...
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excel行列转置，表格处理重复项①在E2单元格输入以下数组公式，②按Ctrl+Shift+Enter组合键结束，③然后向右向下填充公式 =INDEX(B,SMALL(IF(2:...
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多表型大文件GWAS结果使用R语言提取汇总
本脚本适用于GAPIT产生的GWAS结果： 汇总文件在tmp中，输出为csv即可。提取的仅仅是显著位点（阈值自己调整）
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树莓派4b安装ubuntu18.04 server清华源后unzip宝塔
首先找到/etc/apt/source.list，修改成如下即可 用vim全选删除，直接粘贴，wq保存即可、 之后 安装好宝塔，愉快的玩耍吧
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R语言数据整理之行列互换
统计分析时候常常格式录入时候并不是R包想要的格式，如果数据量很大，用excel转换及其麻烦，可以考虑使用reshape2包中的melt函数进行转...
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根据HMP文件统计区间内SNP的个数
现有区间如上，需要统计各区间内的SNP个数 (示例文件中的Chr文件） 公司返还的，或者说从hmp等格式上截取下来的之后SNP位点，例如下图 由...
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服务器上安装bioconductor时遇到的问题
安装bioconductor这次遇到了很大的问题，一直提示若干其他的问题，发现还是网速的和网络链接的问题导致的，时好时不好，这里在在服务器中安装...
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LDheatmap包使用
绘制染色体特定片段的LDheatmap使用LDheatmap包genetics转换数据格式
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GAPIT结果运算和汇总
我们GWAS常用的软件GAPIT很方便，但是如果表型数据多，将最后的数据进行汇总和处理将也是一件很麻烦的事情。这里，我尝试编写了一个小脚本，可以...