发简信
IP属地：北京
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收集各种单细胞测序数据分析方法
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收集一些生物信息学的分析流程的文章。感谢这些简友整理的生信分析流程！ 如果简友投稿没有被我收入专题，可能是我没看到或者收入到其他针对性更强的专题中了。望见谅！ 🕛🕐🕑🕒🕓🕔🕕🕖🕗🕘🕙🕚 文章的收录是有顺序的，查看的时候请点击“最新收录”然后进行查看。 👣 全基因组测序(WGS)分析 👣 转录组分析RNA-seq的分析流程 👣 染色质免疫共沉淀技术ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 👣 单细胞scRNA-seq分析 👣 癌症的预后标志物查找 👣 系统发育演化进化树构建与分析 👣 群体遗传学分析 👣 全基因组关联分析(GWAS) 👣 基因家族的分析 👣 甲基化测序与分析 👣 KEGG/GO功能富集分析 👣 图形绘制具体细节的比如热图、曼哈顿图的绘制等 👣 python、perl、R的包的使用过程 👣 具体工具的使用，比如GATK的使用过程 👣 数据库的挖掘方法，比如TCGA数据库的使用 👣 另外就是整个文章走下来的流程 👣 👣 👣
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转录组
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您好，我现在也在使用这MCScanX-transposed，请问您们还有测试数据吗，可以发我一份吗？1121351469@qq.com,谢谢
MCScanX-transposed安装及使用
1.简介 （1）MCScanX-transposed是基于在相关基因组内和相互之间应用MCScanX，能够检测不同时期内发生的转座基因复制的软件包，也有助于基因复制模式的综合...
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老师，您好。为什么我安装Kent tools的时候用不了make命令
如何安装JCVI
使用conda安装 使用时需要启动环境 在此基础上可以更新到最新版的JCVI (Github版本会不断的增加新功能并修订bug） 安装额外的依赖环境 Kent tools B...
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如何安装JCVI
使用conda安装 使用时需要启动环境 在此基础上可以更新到最新版的JCVI (Github版本会不断的增加新功能并修订bug） 安装额外的依赖环境 Kent tools B...
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南京樱花大学<br>
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为什么我的tbtools里面没有Blast Compare 2 Seq[Sets]<Big File>功能😂😂
TBtools基因家族分析详细教程(3)基因家族成员的进化分析2
基因-共线性的定义与常见算法原理 物种内的共线性分析文件准备（物种比对到自身的.blast文件，物种基因信息文件.gff文件），运行MCScanX，输出collinear和t...
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使用Trinity进行转录组组装Trinity是Broad Institute和Hebrew University of Jerusalem开发的RNA-Seq数据 转录组组装工具，包括三个模块， Inch...
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如何对基因组序列进行注释基因组组装完成后，或者是完成了草图，就不可避免遇到一个问题，需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型，有三种策略： 从头注释(de novo prediction...
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小刘哥，农民、生信民工、程序员、理想主义者
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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请问怎么取出表格啊？😭
R语言GEO数据挖掘：步骤四：富集分析KEGG,GO
1.读取第三部存储数据（基因差异表达情况） 2.设定阈值计算基因上调下调数量 3.ID转换 4.得出差异基因 5. KEGG pathway analysis 做KEGG数据...
