参考资料:参考生物技能树[https://mp.weixin.qq.com/s/TJsdj7qesZGlvmEkNLAy0A]Velocyto官网Tutorial[https...
参考资料:参考生物技能树[https://mp.weixin.qq.com/s/TJsdj7qesZGlvmEkNLAy0A]Velocyto官网Tutorial[https...
经典的转录组差异分析通常会使用到三个工具limma/voom, edgeR和DESeq2, 今天我们同样使用一个小规模的转录组测序数据来演示edgeR的简单流程。 由于,ed...
在准备NGS文库的时候,会有用到转座酶Tn5,Nextera DNA Library Preparation Kit ,比如ATAC-seq就有用到这个Tn5。转座酶携带有特...
这是目前为止我看到过的关于ATAC-seq的最新综述,感兴趣的话值得一读。2020.4.22更新:我看到一个公众号也翻译了这篇文章,而且正好跟我这篇翻译是在同一天发表http...
好奇面试官一般会就生信分析这一块问些什么样的问题,即将面临找工作,毫无面试经验
面试生信工程师2近期又面试了两个生信工程师。 面试者A,两年工作经验,在大厂呆过,做过科服、病原感染、肿瘤检测分析,其中动植物重测序交付项目较多。非科班出身,硕士也是湿实验,自学生信,但能独...
在硕士就读期间,就已经做过 GWAS 相关的分析。当时标记量非常少, windows 系统分析就足够了,作图方面涉及的脚本也基本是蔡师兄帮写的。后来,随着高通量测序成本的降低...
前言 作为表观基因组的工具,MACS2是call peaks强而有力的工具,那么MACS call peak的基本统计学原理是上面呢?大至可以分为3步:1.设置滑动窗口;2....
IGV脚本批量截图 IGV(Integrative Genomics Viewer)是一款本地即可使用的基因组浏览器。我们常常用它来查看一些位点或者区域的变化。在一些文章的附...
作者:白介素2相关阅读:R语言ggplot2绘制箱线图R语言生存分析04-Cox比例风险模型诊断R语言生存分析03-Cox比例风险模型R语言生存分析-02-ggforestR...
随机变量 随机试验的样本空间为Ω,如果对于每一个样本点ω∈Ω,有一个实数X(ω)与之对应,这样得到一个定义在Ω上的单值函数X=X(ω),则称X(ω)为随机变量,简记为X。也就...
随着测序技术的发展,每年测序数据量以PB级增长。随着海量测序数据的增长,越来越多的研究人员开始挖掘公共数据库中的测序数据的意义。已有很多研究表明,某个基因可能参与了某种肿瘤的...
主要从如何看图、用图与作图三个方面来对箱线图进行理解和总结。 1、看图 如图所示,箱线图是将一组数据按照大小顺序排列后进行绘制的,包含6个数据节点,分别表示出数据的上边缘、上...
导读 以前总是借助PS来为新鲜出炉的R图添加统计显著标识,但是现在可以不用了,因为ggbubr可以一站式解决,而且画的图堪比SCI级别。话不多说,撸起袖子搞起来 工作流程 包...
本文用于理解ROC曲线的定义,绘制过程及其应用实现,主要用于自我温习回顾基础 基本目录如下: 什么是ROC曲线?1.1 ROC曲线的历史1.2 ROC曲线的定义1.3 ROC...
欢迎关注”生信修炼手册”! 在之前的文章中,我们提到利用网络聚类算法可以从复杂的蛋白质网络中挖掘蛋白复合体或者相应的功能模块,其中MCODE算法是最常用的挖掘蛋白复合体的算法...
1. 什么是TCGA?TCGA中有哪些数据? TCGA的全称是The Cancer Genome Atlas, 这个项目始于2005年,它旨在使用基因测序和生物信息学编目与癌...
获取代码和更佳阅读体验获取,请移步:相关性分析 | R语言 -- 两个变量的相关性分析[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg4MjY2NT...