华中农业大学<br>园艺植物生物学教育部重点实验室
IP属地：湖北
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WGD（全基因组复制）分析——Ka/Ks及4Dtv值计算一、4Dtv（四倍简并位点颠换率）的定义 4DTV stands for four-fold synonymous (degenerative) third-codon tr...
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生信 | 基因组组装实战（二）：Survey数据质控、NT比对写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1. Survey分析的目的 ...
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生信 | 基因组组装实战（一）：基础知识与基本思路写在前面 以下内容均来自菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培训班课堂笔记 1. Genome de nove 基础知...
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生信 | 基因组组装实战（三）：Kmer评估基因组写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.Kmer定义 杂合Kmer...
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Jellyfish v2.2.10 安装及使用 (2022.02.25)
安装步骤 计算测序数据中的k-mer 示例命令： 参数说明：count 计数模式-m 21 k-mer值设定为21-s 100M 储存在Hash中的k-mer数量为100M-...
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Jellyfish-2的安装与使用说在前头 啥是kmer？ kmer就是一条长度为kbp的DNA string。 Jellyfish有啥用？ 计算输入的基因组数据（fasta）、测序数据（fastq）等，长度...
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2021-01-04 基于k-mer进行基因组大小估算的软件-GCE(gce1.0.2)
使用 GCE 进行基因组大小评估 最近在尝试做基因组大小的评估。尝试了几款软件。今天介绍一下GCE的使用。该软件GCE(Genome Characteristics Esti...
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gce基因组特征评估 2019-07-24GCE下载安装 在Linux系统下，直接在下载链接ftp中下载安装。 GCE主要包含两个主程序：kmer_freq_hash，用于k-mer频数统计；gce，用于基因组特征评...
