发简信
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中山大学中山医学院-基础医学博士在读<br>欢迎关注个人公众号<br><br>公众号：bioinfomics<br>博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fdongwei1220.github.io%2F" target="_blank">https://dongwei1220.github.io/</a><br>
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为什么要以数据库的思维来理解单细胞数据在我们涉足单细胞数据分析不久之后就会发现，我们在和一套新的理念打交道。在这套理念中，对象是常见的，数据是多维的，往往是一张核心表及其附属。我们对一张表是熟悉的，Excel极大...
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【单细胞测序数据分析-1】认识Seurat对象数据结构/数据格式及操作一文了解单细胞对象数据结构/数据格式，单细胞数据操作不迷茫。本文内容包括 单细胞seurat对象数据结构， 内容构成，对象的调用、操作，常见函数的应用等。 1. 单细胞seu...
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肿瘤外显子全流程notesPart0背景知识 Q：什么是外显子测序呢？A：外显子组测序是指利用序列捕获或者靶向技术将全基因组外显子区域DNA富集后再进行高通量测序的基因组分析方法。外显子组包含约1%的...
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优雅地做一名极客
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【10X空间转录组Visium】（六）新版Seurat v3.2分析Visium空间转录组结果的代码实操旧号无故被封，小号再发一次 更多空间转录组文章： 1. 新版10X Visium 【10X空间转录组Visium】（一）Space Ranger 1.0.0(更新于20191...
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单细胞测序（scRNA-seq）通关||数据处理必知必会单细胞转录组数据分析系列教程 sc-RAN-seq 数据分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[https://www.jians...
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Seurat重要命令汇总
参考：https://satijalab.org/seurat/articles/essential_commands.html[https://satijalab.org/...
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南京大学生物学，佛系更新~
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小试牛刀——学会开Seurat函数“盲盒”
水有源，故其流不穷；木有根，故其生不穷。 长期以来，我们的单细胞分析仅仅停留在调包、套函数、……，这个过程会“蒙住”我们的眼睛，有些时候我们需要知道每个函数究竟在干什么才能够...
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sc-RAN-seq 数据分析||Seurat新版教程: Using sctransform in Seurat本教程介绍了Seurat包与sctransform 包一起分析时候的一般方法。首先你也许会问：sctransform包是用来干嘛的？ 这是一个值得关心和探讨的问题，我也将做一...
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Seurat 基础知识
（一）Seurat的数据结构 版本：3.1.5 直接输入Seurat object的名称，我们可以得到类似如下内容： An object of class Seurat 13...
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Seurat Weekly NO.2 || 我该如何取子集？Seurat Weekly NO.0 || 开刊词Seurat Weekly NO.1 || 到底分多少个群是合适的？！ 在过去的一周里Seurat社区在github总提问数...
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Seurat Weekly NO.1 || 到底分多少个群是合适的？！Seurat Weekly NO.0 || 开刊词 在过去的一周里Seurat社区在github总提问数由上周的3066上升到3090，当然有同一问题反复讨论的情况，也有之前...
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周运来，男，长大了才会遇到的帅哥，稳健，潇洒，大方，靠谱。一段生信缘，一棵技能树。生信技能树核心成员，单细胞天地供稿人，简书创作者，单细胞数据科学家。
