R语言绘图包系列： R语言绘图包01--优秀的拼图包patchwork[https://www.jianshu.com/p/e57555d48c91] R语言绘图包02--热...
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R语言绘图包13--共表达网络的绘制：igraph -
收集一些生物信息学的分析流程的文章。感谢这些简友整理的生信分析流程！ 如果简友投稿没有被我收入专题，可能是我没看到或者收入到其他针对性更强的专题中了。望见谅！ 🕛🕐🕑🕒🕓🕔🕕🕖🕗🕘🕙🕚 文章的收录是有顺序的，查看的时候请点击“最新收录”然后进行查看。 👣 全基因组测序(WGS)分析 👣 转录组分析RNA-seq的分析流程 👣 染色质免疫共沉淀技术ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 👣 单细胞scRNA-seq分析 👣 癌症的预后标志物查找 👣 系统发育演化进化树构建与分析 👣 群体遗传学分析 👣 全基因组关联分析(GWAS) 👣 基因家族的分析 👣 甲基化测序与分析 👣 KEGG/GO功能富集分析 👣 图形绘制具体细节的比如热图、曼哈顿图的绘制等 👣 python、perl、R的包的使用过程 👣 具体工具的使用，比如GATK的使用过程 👣 数据库的挖掘方法，比如TCGA数据库的使用 👣 另外就是整个文章走下来的流程 👣 👣 👣
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生信技能树：https://vip.biotrainee.com/ Openbiox： https://community.openbiox.org/ 公众号：优雅R 生物数据分析QA，技术文档与博客，需要你的参与。 ……………………………… 欢迎在简书创作和做笔记的生信学习者、爱好者以及相关编程人员加入本专题，贡献你的文字，无论是原创还是笔记，我们需要你，将本专题打造为生信知识宝库、交流平台。 内容可以是对生物信息学与算法知识相关资源的收集、整理，以及原创笔记： * R * Python * Perl * Linux 工具与编程 * 绘图 * 统计 * 计算生物学 * 各类算法 * 机器学习
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一文说清楚衰老T细胞的研究进展一、摘要 据世界卫生组织统计，目前全球大多数人的预期寿命均已达到60岁及以上；预计到2034年，老年人的数量将超过儿童；而到2050年，全球60岁及以上人口将达到21亿人，其...
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RNA-seq入门实战（二）：上游数据的比对计数——Hisat2+ featureCounts 与 Salmon本节概览：hisat2 + featureCounts:获取hisat2索引文件，hisat2比对和samtools格式转化，featureCounts计数得到counts表...
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跟着Nature Communications学作图：R语言circlize包做漂亮的弦图论文 A latitudinal gradient of deep-sea invasions for marine fishes https://www.nature.co...
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🤩 funkyheatmap | 用这个包来完美复刻Nature Biotechnology的高颜值神图吧！~写在前面 天气开始暖和了☀️，发现旅游的人好多啊！~🥲 不知道自己什么时候能有时间出去看看外面的世界，实在是太忙了。😷 最近用到的有个包感觉很不错，分享给大家，funkyhe...
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10X单细胞基础+个性化合集2作者，Evil Genius 这一篇分享以下后三个部分 单细胞个性化分析之细胞通讯篇 单细胞个性化分析之CNV篇 单细胞个性化分析之转录因子篇 单细胞个性化分析之细胞通讯篇 ...
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【单细胞高级绘图】07.KEGG富集结果展示这一节画的图是比较新的，图中我用红色箭头标出的是pathway 注释信息(big annotation，自己想的，非专有名词)，纵轴花花绿绿的标注是pathway的 注释(s...
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跟着Nature学作图：R语言ggplot2山脊图添加辅助线论文 Graph pangenome captures missing heritability and empowers tomato breeding https://w...
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文章复现-全外显子数据分析学习7-bam文件载入igv可视化what is bam bam（或者是sam，cram）文件，是比对后拿到的文件，sam文件是纯文本，非常占用存储空间，bam是sam的二进制格式，cram则是进一步压缩后的...
