最近用Orthofinder做物种进化树,最后出来的物种树的结构跟已发表研究的结果差距较大,在我的印象里Orthofinder软件是用单拷贝直系同源基因进行建树的,然后跟老师...

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最近用Orthofinder做物种进化树,最后出来的物种树的结构跟已发表研究的结果差距较大,在我的印象里Orthofinder软件是用单拷贝直系同源基因进行建树的,然后跟老师...
@郝永超M1racle 谢谢~,我是用自己租的服务器跑的,23333。我找人用组里服务器试试。
单拷贝直系同源基因构建物种进化树最近用Orthofinder做物种进化树,最后出来的物种树的结构跟已发表研究的结果差距较大,在我的印象里Orthofinder软件是用单拷贝直系同源基因进行建树的,然后跟老师...
@郝永超M1racle 好的好的,十分感谢,我手动操作改好名了。可是用fasttree建树的时候,在222.86秒的时候,跑出out of memory报错,您知道是什么原因嘛
单拷贝直系同源基因构建物种进化树最近用Orthofinder做物种进化树,最后出来的物种树的结构跟已发表研究的结果差距较大,在我的印象里Orthofinder软件是用单拷贝直系同源基因进行建树的,然后跟老师...
您好,您这行代码是在进行什么操作呢python ~/hychao/script/format_mergeFA.py all.aln.fa > format.all.aln.fa
单拷贝直系同源基因构建物种进化树最近用Orthofinder做物种进化树,最后出来的物种树的结构跟已发表研究的结果差距较大,在我的印象里Orthofinder软件是用单拷贝直系同源基因进行建树的,然后跟老师...
写在前面 两个月前,我推送了一个师妹的投稿,介绍了orthofinder软件的应用场景和具体安装,属于上篇。有上便有下,评论区和后台看到不少朋友在催更下篇。今天即推出,主要内...