最近因为之前的测序company又菜又马虎，忍无可忍，常换常新。在适应新公司送样方式和测序结果等等的时候，学到了一些东西，也是今天想要分享的两点： 1.最最常用的核酸检测技术...
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测序忘了发给你拼接结果？不用慌，咱们自己来！ -
CFVisual绘制Motif+基因结构+结构域+进化树+启动子图的单独或组合图1. 软件简介 CFVisual_V2.1软件是一款借助Python语言的matplotlib库和PySide2库进行生物序列结构绘图的数据可视化软件，主要用于生物信...
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TBtools | 多图合一至强版教程！进化树 + Motifs + 结构域 + 启动子 + 基因结构 + ....放一张效果图，这些，三四年前的东西，我其实一直懒得说。 写在前面 “Gene Structure View (Advanced)”这个功能可以说，也是一时兴起写出来的。开发的...
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植物启动子-顺式作用元件-批量提取-预测-可视化分析写在前面 以前总看到问题是，基因结构可视化的问题；现在则变成了启动子元件的预测或者说可视化。这本身比较简单，也比较玄乎，所以我一直不是太乐意与别人讨论。但学院今天断网，手上的...
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荧光定量（qPCR）结果整理的辅助小工具写在前面 荧光定量（qPCR）早已是各个分子生物学实验室常用的简单的实验技术。十年的变化很大。10年前（我大一）到实验室时，常规的pcr都不舍得加多0.2ul的rTaq，更不...
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实时荧光定量 PCR
实时荧光定量 PCR，简称 RT-QPCR, 属于 Q-PCR 的一种，目前该技术已得到广泛应用，如：扩增特异性分析、基因定量分析、基因分型、 SNP 分析等。荧光定量 ...
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跟着视频课学习TBtools热图的绘制，轻轻松松就搞定啦#热图的构成 主要内容就是1. tile plot 方块图；2. 左侧和上方可加进化树；3. legend图例。 #热图的用途 一句话总结，通过颜色的变化实现数据的可视化。 ...
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在线绘制聚类热图（heatmapper）
在线绘制聚类热图 - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com/p/9d26bd8cd539?utm_campaign=haruki&...
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物种内共线性圈图绘制，有那么难吗？写在前面 我受够了！整天有人问，TBtools怎么画这个图 但是我其实只想回一句： 你画这个图干什么？有什么意义？你想说谈什么生物学故事？ 承认吧，你什么都不知道，什么都没搞...
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进化树在线制作工具iTOL教程（2）：添加文本添加文本 利用iTOL，我将进化树分为三个群体，接下来就是添加文本 与evolview一样，添加文本需要datasets，依然可以去参考help页面 这里我放上了官网中所有参...
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Phylogenetic tree——系统发育树的生成有人说生命科学的所有问题的答案都应该到进化里寻找，还有人说不懂进化的生命科学家是耍流氓。 系统发育树或进化树是一种常用来表示物种宗谱亲缘关系的树状结构图。在分子水平，亲缘关系...
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保姆级教程：手把手教你画出内容丰富的基因结构图 （进化树+CDD+UTR/CDS）写在前面：在基因家族生信分析（二）这篇文章里，简单提到了一种基因结构绘制的方法，当时是跟着视频课做笔记，没有实际操作。直到今天实际操作了一下，发现有很多需要注意的地方，今天就...
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用MEGA软件构建NJ树（Neighbor-Joining）MEGA (Molecular Evolutionary Genetics Analysis)— 分子演化遗传分析 MEGA是一款操作简单的系统发育分析软件。 NJ法构建的树...
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MEGA 构建进化树步骤
【转载】 分子进化的研究对象是核酸和蛋白质序列。研究某个基因的进化，是用它的DNA序列，还是翻译后的蛋白质序列呢？序列的选取要遵循以下原则：1）如果DNA序列的两两间的一致度...
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分子进化树构建及数据分析方法介绍【转】
首先是方法的选择。基于距离的方法有UPGMA、ME（Minimum Evolution，最小进化法）和NJ（Neighbor-Joining，邻接法）等。其他的几种方法包括M...
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基因家族分析（1）——进化树构建与美化更多内容关注微信公众号：“今日之森” 后获取。 “好看的皮囊千篇一律，有趣的灵魂万里挑一” 进化树的构建绝不仅仅是将一堆序列扔进MEGA等建树软件，随便生成树那么简单，因为总...
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【可视作图】MEGA7 构建 NJ 树MEGA7软件下载及安装 http://www.megasoftware.net/ 支持建树类型 数据准备 TIR.fasta 导入文件 选择Align 导入成功 选择比对方...
