原文链接:https://zhuanlan.zhihu.com/p/401460339 (伯远生物) 01 启动子的基本类型 启动子是基因的重要组成部分,其主要功能为调控基...
全基因组关联研究(GWAS)已经确定了数千种与许多复杂特征相关的遗传变异。然而,它们的生物学机制在很大程度上仍然是未知的。最近提出的全转录组关联分析(transcriptom...
shell脚本 目录 启动行参数解析[#%E5%90%AF%E5%8A%A8%E8%A1%8C%E5%8F%82%E6%95%B0%E8%A7%A3%E6%9E%90] 参数...
记录下小编自己可能用到的小脚本 (1)fasta转phylip格式 用法:python fa2phy.py seq.fasta seq.phy (2)fastq转fast...
之前使用的是3D-DNA流程做Hi-C的辅助组装,它的最大优势就是输出结果可以对接下游的JBAT(juicerbox with Assembly Tools)进行手动矫正。然...
文章转自: https://zhuanlan.zhihu.com/p/393768977 所以,这里只推荐R包ggsci,具体到只推荐ggsci包中几种主流期刊的颜色方案。毕...
今天运行一个程序的时候,出现了一个让我惊讶的报错, 照理说,基因组上的序列应该只有ATCG,以及用来填充gap的N才对,为啥会出现Y呢?于是我用grep又去搜索了下,出现了更...
Seurat Weekly NO.0 || 开刊词 在过去的一周里Seurat社区在github总提问数由上周的3066上升到3090,当然有同一问题反复讨论的情况,也有之前...
拟时(pseudotime)分析,又称细胞轨迹(cell trajectory)分析,通过拟时分析可以推断出发育过程细胞的分化轨迹或细胞亚型的演化过程,在发育相关研究中使用频...
Luecken MD, Theis FJ. Current best practices in single-cell RNA-seq analysis: a tutoria...
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TY - JOURAU - Shafer, Maxwell E. R.M3 - 10.3389/fcell.2019.00175TI - Cross-Species ...
RNA速度详细显示了神经元和其他的细胞如何在大脑发育和成熟时获得它们的特定功能。我们特别兴奋的是,这种新方法有望协助揭示出大脑通常如何发育,同时也为破解人类大脑发育障碍(比如...
将染色体从contig/scaffold水平提升到chromosome水平是组装的最终目标。我们通常使用遗传图谱,光学图谱,HiC这些技术提供的信息将contig进行排序连接...