请问一下,单个snp的加性遗传效应怎么估计啊?
您好,我想请教一下GWAS模型选择的问题,我看文章里说对于二分类性状,如雌雄性别,抗病和感病等用的是卡方或者是logstic,但是我看一些发表的文章里面用的是LMM或者是GLM,这个在选择上有什么要求吗?
GWAS:表型的标准化(the normalization of phenotype)GWAS表型的标准化方法一般有Quantile normalization、Inverse rank normalization、Z-score normalization等...
您好,我想问一下,对于抗病和感病(0和1)这种质量性状,是不是只能用逻辑斯蒂和卡方两种模型?
重测序分析(18)GWAS分析实操(4)gwas_tassel_mlm混合线性模型MLM:GLM模型中,如果两个表型差异很大,但群体本身还含有其他的遗传差异(如地域等),则那些与该表型无关的遗传差异也会影响到相关性。MLM模型可以把群体结构的影...
博主脚本代码能分享下吗?
2018-10-05 如何把vcf 文件合并最近使用了CLC做分析,发现收费软件的速度真的是很快哇,而且可视化界面设计的很不错。但是我们也不能太依赖这些收费的软件,比如我先在得到了每个样本的vcf文件,我想合并,这个软...
@董八七 请问能否出一期详细解说这个软件的文章或者视频呢,自己跑出的结果感觉不对,不知道哪个地方出错
系谱重建 colony 使用指南最近在用Colony,和Cervus有所区别。下面是翻译自Colony的用户指南,供理解学习。软件下载地址官方COLONY | Zoological Society of L...