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在热图中标注出特定基因的名称对于基因的差异表达谱，常用热图作为展示。但有时差异基因可能非常的多，热图中不可能将所有基因的名称标注出来。那么此时不妨选择一些比较重要的基因（比方说p值最显著的那些），在图中...
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TCGA 数据挖掘+实验验证（老牌期刊非OA 准8分）
今天分享一篇TCGA数据挖掘+实验验证的文章，文章发表业内老牌期刊Oncogene上，影响因子：7.971，中科院最新分区：1区，非OA期刊。参考文章来源：PMID: 334...
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抓住一个热点，可以发无数篇纯生信SCI
现在都是流行追热点，例如m6A这个研究热点，很多人利用它发了n篇纯生信数据挖掘的文章；再比如铁死亡这个研究热点，有一大堆纯数据挖掘的文章正在投稿中；现在我们看看这个已经发了无...
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按照这种思路，一个基因就可以发一篇SCI今天分享一下一个基因就可以发一篇SCI的套路，文章主要思路就是利用TCGA数据挖掘出一个值得研究的基因，然后补充相关的实验验证。这个思路的发文机会比纯纯数据挖掘的机会大，因为...
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基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis, GSEA)
前面简单介绍过基因矩阵转置文件格式（* .gmt）[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4ODE0NTE3OA==&mid=26492005...
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GEO数据挖掘筛选关键基因，然后实验验证的发文思路
科研资源不同，自然选择就不同。没有科研经费的人会比较喜欢纯生信数据挖掘这种模式；有科研经费的人可能更喜欢生信+实验这种模式。之前纯生信数据挖掘的发文思路已经分享了很多，所以这...
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基于基因家族的生信发文思路本次分享一下基因家族的生信发文思路，文章发表在Cancer Medicine上，影响因子：3.491，中科院分区：三区。作者分析了exostosin蛋白家族的两个基因：EXT...
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医生/医学生-这是最好的时代，还是最坏的时代
100多年前狄更斯说： 这是一个最好的时代，这也是最坏的时代； 这是一个智慧的年代，这是一个愚蠢的年代； 这是一个信任的时期，这是一个怀疑的时期； 这是一个光明的季节，这是一...
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收集一些生物信息学的分析流程的文章。感谢这些简友整理的生信分析流程！ 如果简友投稿没有被我收入专题，可能是我没看到或者收入到其他针对性更强的专题中了。望见谅！ 🕛🕐🕑🕒🕓🕔🕕🕖🕗🕘🕙🕚 文章的收录是有顺序的，查看的时候请点击“最新收录”然后进行查看。 👣 全基因组测序(WGS)分析 👣 转录组分析RNA-seq的分析流程 👣 染色质免疫共沉淀技术ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 👣 单细胞scRNA-seq分析 👣 癌症的预后标志物查找 👣 系统发育演化进化树构建与分析 👣 群体遗传学分析 👣 全基因组关联分析(GWAS) 👣 基因家族的分析 👣 甲基化测序与分析 👣 KEGG/GO功能富集分析 👣 图形绘制具体细节的比如热图、曼哈顿图的绘制等 👣 python、perl、R的包的使用过程 👣 具体工具的使用，比如GATK的使用过程 👣 数据库的挖掘方法，比如TCGA数据库的使用 👣 另外就是整个文章走下来的流程 👣 👣 👣
