导语: 前面的推文简要介绍了Jalview的大体功能,本以为对该软件的需求不会很大。但是随着这几篇推文“,”中发现的一些问题,今天有必要对Jalview这款多序列比对软件的具...
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前言生物技术近年发展越来迅猛,掌握一门生信语言或者一个生信软件的使用,这将为我们的科研学习之路提供非常大的便利。今天我们主要来介绍如何用MEGA7进行进化树。1、下面以MEG...
前言 认识文件名,这玩意太重要了!行外人看不懂啊!!!!!! 高逼格的东西自己阅读参考文件了,我只上最粗暴的!~ 尼马的,给我记好了,不然在GWAS分析的路上活不下的!!! ...
前言 这年头,谁还TM的做GWAS~ 今天导师不是想和你看流星雨, 是想和你看看他感兴趣SNPs在某个亚组数据中的基因型....... 怎么办? I have 一堆SNPs,...
我梳理了GWAS全基因组关联分析的整个流程,并提供了基本的命令,用到的软件包括BWA、samtools、gatk、Plink、Admixture、Tassel等,在此分享出来...
GEMMA(Genome-wide Efficient Mixed Model Association algorithm)是一款基于混合线性模型的GWAS分析软件(文献信息...
一、何为GWAS? GWAS(Genome-wide Association Study)是对多个个体在全基因组范围的遗传变异(标记)多态性进行检测,获得基因型,进而将基因型...
http://blog.sina.com.cn/s/blog_e6c5efde0101lgfi.html进化树以图像的形式反映序列比对的结果,但是有的时候,序列比对没有办法确...
软件准备:GeneDoc下载地址http://www.jalview.org/getdown/release/[http://www.jalview.org/getdown/...
更多内容关注微信公众号:“今日之森” 后获取。 直奔主题 基因家族分析(1)——基因家族成员的确定①简单介绍了一下分析策略和数据下载。 今天就随便找一篇文章,通过实践操作来快...
森言森语 毕业季,总会有各种各样的遗憾,但我们还是期望认真、努力,好好对待遇见的人和遭遇的事,少一些遗憾,多一些收获。毕业前我们总是嚷嚷着要毕业,马上就要离开学校的时候,其实...
做实验嘛,时间和精力的合理分配很重要,利用有限的时间高效完成各项实验的准备工作就显得尤其必要。毕竟需要把更多的时间花在研究文献上面,然后仔细验证实验思路,最后快快的做实验。 ...
本文将介绍骨架载体+目的基因序列合成方法 在合成之前,应该先确定骨架载体backbone+基因序列。其中,骨架载体是根据自己的实验需要来决定。 一:目的基因获取 在进行PCR...
在进化树建完后,需要对序列的结构进行分析。这里需要区分两个概念,即蛋白结构域与保守结构域,它们两个不是一回事。从上一章,通过pfam方法同学们可以获得蛋白结构域的信息(即结构...