在转录调控相关的文献中，我们经常能够看到这样的蛋白质相互作用网络（protein protein interaction network，PPI network）。具体而言，...
IP属地：黑龙江
-
STRING数据库的蛋白质相互作用（PPI）网络分析 -
48个实用的生信在线工具
在线工具一般具有“功能强大、操作简单、无需安装、用完就走”的特点，轻松实现“用别人的服务器分析自己的数据”。 基因结构绘制 1.Exon-Intron Graphic Mak...
-
Cytoscape插件7：MCODE
MCODE,Molecular COmplex Detection发现PPI网络中紧密联系的regeions，这些区域可能代表分子复合体。根据给定的参数，分离dense re...
-
使用Cytoscape构建三层网络，并进行模块挖掘使用Cytoscape构建三层网络，并进行模块挖掘 我这部分要做的是”药物-不良反应-靶点”三层网络 虽然在做网络这方面我也不是很熟练，但是把过程和大家分享一下，可以交流，欢...
-
cytoscape操作指南首先，在https://cytoscape.org/网站下载cytoscape软件并安装好，注意本软件需要安装java 其次，获取基因间相互关系的数据，以本文为例，通过WGC...
-
GEO数据库学习总结（三）ID转换通过前面的数据下载，我们一般都可以得到如下矩阵，为了后续分析及文章需要，我们则需要吧探针名转化为gene_symbol ID转化主要分为二步 Ⅰ、得到探针一一对应的基因名Ⅱ、...
-
GEO数据挖掘（一）：GEOquery包的快速安装GEOquery是从网络下载GEO数据并导入R的一个包。官方推荐的安装方法： 网速太差，多次尝试都中断了，最后以失败告终。于是官网下载源码，RStudio安装，出奇快，30s...
