CellChat三部曲1：使用CellChat对单个数据集进行细胞间通讯分析 自从周运来在简书写了一篇cellchat的中文介绍教程，然后R包作者也在B站做了直播介绍，cel...
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CellChat三部曲1：使用CellChat对单个数据集进行细胞间通讯分析 -
单细胞转录组基础分析七：差异基因富集分析
本文是参考学习单细胞转录组基础分析七：差异基因富集分析[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIyMzMwNDQ2MA==&mid=22474...
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单细胞之富集分析-3：GO和KEGG富集分析及绘图单细胞富集分析系列： 单细胞之富集分析-1：单细胞GSEA分析流程[https://www.jianshu.com/p/00f069cb239c] 单细胞之富集分析-2：批量...
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【细胞通讯】CellChat前面关于细胞通讯的理论学习提到过，邻接型的传递主要包含我们所熟知的神经信号传递和抗原呈递，主要是细胞表明配体-受体的相互作用。而扩散型的信号传递方式则是以分泌蛋白为主，例如很...
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一文解决Cellphonedb单细胞互作分析及可视化作图（2）之前我们已经讲述了Cellphonedb的安装配置和数据分析，就差可视化了，这里简单说一下常见的可视化，如果需要其他更加个性化的可视方式，就需要发挥自己的聪明才智了！ Cel...
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公众号：TOP生物信息<br>B站：TOP菌<br>WeChat：TOPJUN996<br><br>top2读研，学习方向：癌症基因组、肿瘤免疫、单细胞组学
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IF 38！如何用单细胞多组学思路研究肿瘤异质性肾透明细胞癌（ccRCC）是肾细胞癌中最常见也最具侵袭性的癌症亚型，容易术后复发和转移，预后较差。目前，ccRCC的治疗方法主要包括常规化疗、靶向治疗和免疫治疗，但疗效受到肿...
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单细胞经典的课题设计思路
本文首发于单细胞天地[https://mp.weixin.qq.com/s/xihGDNTqVL27lk_47lPNIA] 一、单细胞的应用 根据单细胞的应用方向主要可以分为...
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IF 41！肿瘤单细胞研究新思路：乳腺癌中新巨噬细胞类群发现与研究在我国，乳腺癌发病率呈逐渐上升趋势，是严重危害妇女健康的恶性肿瘤。巨噬细胞是乳腺癌微环境的主要细胞类型。肿瘤相关巨噬细胞通常具有促癌和免疫抑制功能，与不良预后相关，但也有报道...
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浅浅的学习历程<br>生信新手，打工人，搬运工。<br>像王子文一样财务自由，才可实现生育自由<br>像李子柒一样把一件事情做到极致，才可实现职业自由
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使用cellchat进行细胞间通讯分析
安装R包 如果安装不成功，可能是1.You might need to manually intall the dependencies ComplexHeatmap usi...
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学习CellChat细胞间通讯分析1学习 CellChat 细胞间通讯分析 [第一部分：CellChat对象的数据输入&处理及初始化] (2022-05-22 - 简书 (jianshu.com)[https:...
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单细胞分析之细胞通讯：cellchat这篇文章在2020年7月上传到了bioRxiv（Inference and analysis of cell-cell communication using CellCha...
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10X单细胞（10X空间转录组）肿瘤数据分析之肿瘤进化树作者，追风少年i hello，大家好，新的一周，新的开始，脑海里浮现周星驰的一句台词，只有越来越强大，才能越来越童话。 今天我们简单来学习一个简单的内容，肿瘤进化树，先看示例...
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scRNA-Seq | 单细胞亚群合并与提取本文涉及：亚群合并，亚群提取，亚群细分，亚群抽样 一般来讲，不同亚群的细胞具有不同的功能，因此亚群分析对于研究十分重要，会影响后续分析结果。 进行细胞亚群的分群的依据： 细胞...
