参考:ICGC数据库数据提取表达矩阵/如何提取癌症数据--生信自学网使用spread 出现的坑--刘小泽简书 目的:当我们使用TCGA 表达数据,数据以gene-sample...
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Systematic profiling of immune signatures identifies prognostic predictors in lung aden...
GEO数据挖掘或转录组分析差异表达[https://www.plob.org/tag/%e5%b7%ae%e5%bc%82%e8%a1%a8%e8%be%be]基因时,结果中...
imma,edgeR,DESeq2三大包基本是做转录组差异分析的金标准,大多数转录组的文章都是用这三个R包进行差异分析。edgeR差异分析速度快,得到的基因数目比较多,假阳性...
38. ROC曲线图绘制 清除当前环境中的变量 设置工作目录 使用ROCR包绘制ROC曲线 使用pROC包绘制ROC曲线图 使用survivalROC包绘制时间依赖的ROC曲线
介绍 一致性聚类是一种为确定数据集中可能的聚类的数量和成员提供定量证据的方法,例如作为微阵列基因表达。这种方法在癌症基因组学中得到了广泛应用,在那里发现了新的疾病分子亚类。 ...