木夕月 - 简书

木夕月

IP属地：湖北

利用ChIPseeker注释peak分布
1.准备 TxDb 2.读入peak文件 3.画图

0.1 18 0 1
minimap比对
参考：[GitHub - lh3/minimap2: A versatile pairwise aligner for genomic and ...

1.6 920 0 3

hifiasm组装
参考hifiasm网页代码： https://github.com/chhylp123/hifiasm[https://github.com/c...

0.5 2063 0 4
canu 组装PacBio数据
基因组组装的三个层次，contig, scaffold和chromosomes.contig表示从大规模测序得到的短读(reads)中找到的一致...

2.5 1884 0 10
CHIP-seq（四）motif analysis
HOMER is a software for motif discovery and ChIP-Seq analysisHOMER软件使用Pe...

0.2 791 0 2
ChIP-seq（三）MACS2 peak calling
MACS2（Model-based Analysis of ChIP-seq）usage： -t：--treatment file；-c：Con...

0.8 1789 0 4
ChIP-seq（二）Visualization
可视化Visualization Convert bam to BigWig 1. bam to bedGraph：bedGraph存放区间的坐...

1.3 1618 2 10

ChIP-seq（一）
Homo sapiens，neuron神经元细胞的数据分析； 1. rawdata数据处理了解ChIP-seq的实验流程 (qq.com)[h...

1.7 725 0 5
WGS数据分析（二）
manta call SV 结构变异（structural variants）主要找 ---缺失(Deletion) 大于50 bp---易位(...

0.2 1670 0 3