请问累计基因组位置的mutate(chr_cumsum = cumsum(c(0, head(chr_lengths$chr_len, -1)))[CHR]) 这一步是什么意思?
2024-09-05 | ggplot绘制曼哈顿图----受够了有些包的自定义限制整体脚本如下,需要你的文件包含CHR BP P三列,无所谓顺序,也无所谓有啥其他列,只要有这三列即可 结果如下
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2024-09-05 | ggplot绘制曼哈顿图----受够了有些包的自定义限制整体脚本如下,需要你的文件包含CHR BP P三列,无所谓顺序,也无所谓有啥其他列,只要有这三列即可 结果如下
请问这个run_pipeline.pl脚本在哪?
格式转换--2024-03-23格式转换hapmap格式:hmp.txtplink格式:ped和map以及二进制文件bed/bim/famvcf格式:vcf 1. hapmap <-> vcf hapm...
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1. 直方图 直方图是将单个变量分隔成若干个区间,并对区间内的观测值进行计数。 geom_histogram 函数可用于绘制直方图, 而它的变体 geom_freqpoly ...
一、软件安装 软件安装可以参考Jimmy写的软件的安装代码:生物信息学常见1000个软件的安装代码!http://www.biotrainee.com/thread-856-...
https://www.routledge.com/Chapman--HallCRC-The-R-Series/book-series/CRCTHERSER?pd=publi...
1.前言 melt() 是 reshape2包中的一个函数,它用于将数据框从“宽格式(wide format)”转换为“长格式(long format)”。 宽格式指的是一列...
为什么我按照一样的代码画出来的y轴,不是个每个bin的个数,是比例呢?
ggplot,geom_histogram画直方图所用R 包 ggplot2 数据: 最终效果: 代码 分步说明: 一、指定数据集 告诉ggplot要以phynotype这个表格画图,把RSRDS列作为x轴; 二、画图类型为...
新建一个字典,将序列信息读进去,这个代码的缺陷就是只能读一个,到第二个就停止了 接下来的这个代码是可以读取多个序列
用到了pandas和biopython模块
本节概览1. WGCNA基本概念:定义、关键术语、基本流程、一些注意事项2. WGCNA运行:⓪输入数据准备①判断数据质量,绘制样品的系统聚类树②挑选最佳阈值power③ 构...
论文 A highly conserved core bacterial microbiota with nitrogen-fixation capacity inhabit...