IGV是一个十分常用且好用的可视化基因组NGS测序信息的软件包，很厉害的一软件，不仅可以windows可视化操作，还可以写代码获取自动截图等，软件官网：http://www....
发简信
IP属地：江苏
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使用IGV根据引物确定PCR产物序列位置 -
fastq、fasta、bed、gtf、gff、sam、bam生信分析常见文件格式查看生信分析过程中的文件格式：除了原始测序数据fastq、fasta之外，还有基因组文件fasta格式，基因注释文件gtf格式。在分析的过程中还会有众多中间文件的生成，如bed、...
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2021-03-26 一文教会你查找基因的启动子、UTR、TSS等区域以及预测转录因子结合位点来源：https://cloud.tencent.com/developer/article/1189476 基础知识 首先我们了解一些基础知识（注：文中图片皆可点击放大查看...
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简述CRISPR技术最近在学习表观遗传的内容，对CRISPR技术产生了兴趣。想详细的了解一番，找个好几个帖子，这篇是目前找到的既简洁通俗又不乏深度的高质量的说明贴，分享给大家，侵权删。原文如下：...
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按照实际比例画韦恩图的R包~eulerrR语言里画韦恩图长用到的R包有 Venndiagram ggvenn ggVennDiagram 这几个包有一个缺点就是最终呈现的图不是按照数据集的实际比例来的。每个部分的圆...
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推荐一款好用的基因结构图在线绘制工具！科研绘图是一项基本技能，之前为大家分享过一期我们组学大讲堂绘图工具合集：收藏贴-绘图工具教程合集-科研必需技能！共20类37种绘图方法，基本涵盖了科研常见绘图需求，喜欢的赶紧...
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Haploview软件使用-连锁不平衡分析
当位于某一座位的特定等位基因与另一座位的某一等位基因同时出现的概率大于群体中因随机分布的两个等位基因同时出现的概率时，就称这两个座位处于连锁不平衡的状态。目前，连锁不平衡分析...
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正态性检验-多种检验方法
其实好多细心的小伙伴都发现了，我们在进行部分常规统计操作前，很多限制条件都是规定数据必须满足正态分布，那今天我将介绍几种SPSS中检验数据正态性的方法。 一、S-W（夏皮洛...
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基因家族分析1 || 基本概念及数据下载基本分析内容 • 基因家族概念• 数据库检索与成员鉴定• 蛋白成员基本特性和基因结构分析• 多序列比对和进化树分析• 保守结构域和模体分析（motif注释...
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OrthoFinder寻找同源基因并建树提到寻找物种之间的同源基因，大家一般想到的是OrthoMCL (http://orthomcl.org/orthomcl/） ，OrthoMCL是现在用的最多的一款来找直系同...
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基因家族分析 | 基因家族成员鉴定(hmm模型＆同源blast)方法一：基于hmm模型的鉴定方法 1.准备数据①下载拟南芥基因组fasta文件、注释文件gtf/gff3文件：ftp://ftp.ensemblgenomes.org/pub...
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GWAS生物学相关名词解释
背景基因 与所研究的表现型直接有关的基因以外的全部基因的总称 LD : 当位于某一座位的特定等位基因与另一座位的某一等位基因同时出现的概率大于群体中因随机分布的两个等位基因同...
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GWAS之表型最优无偏预测（BLUP)与遗传力计算表型分析之最优无偏预测 最佳线性无偏预测（Best Linear Unbiased Prediction，简称BLUP）可以对多环境数据进行整合，去除环境效应，得到个体稳定遗...
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StatQuest（PCA系列）step by step为你解释PCA的那些事儿这篇笔记记录的是StatQuest的PCA系列的视频。一共是3个视频，其中第一个和第三个视频很短，五六分钟的样子，中间的长一点。但是这3个视频真的是从浅入深的介绍了PCA分析...
