1 简介 BCFtools 是一款多种实用工具的集合,它可以用于处理VCF文件和二进制的BCF文件。它可以接受VCF格式、压缩的VCF格式以及BCF格式,并能自动检测输入的格...
1 简介 BCFtools 是一款多种实用工具的集合,它可以用于处理VCF文件和二进制的BCF文件。它可以接受VCF格式、压缩的VCF格式以及BCF格式,并能自动检测输入的格...
@学术程稻属 谢谢老师,非常感谢!
遗传统计|BSA-seq混合分组鉴定功能基因分离体分组混合分析法(Bulked Sergeant Analysis, BSA)也称为集群分离分析法或混合分组分析法,是从近等基因系分析法演变而来的。常规的育种通常从近等基...
我有 delta SNP 的数据,如何获得滑动窗口 (2000kb,100kb) 的delta SNP 平均值呢?
《BSA》-生信笔记---003背景介绍 一、什么是BSA? BSA(Bulked Segregant Analysis)---混合分组分析法 >根据目标性状表现型,对表型分离群体中的个体/株系依据目标性状...
delta SNP-index 值在 5 号染色体有个明显的负值峰,说明了什么?
使用QTLseqr进行BSA-seq分析QTLseqr是一个用于BSA-seq的R包,它能够读取GATK输出结果进行过滤,最终使用SNP-index和G 统计值的方法进行定位。我们这次尝试使用这个R包来替代我们自己...
有野生型与突变体混池snp-index和野生型与野生型混池的snp-index值,那么delta SNP-index 的数据如何获得呢?两个文件的 SNP位点有相同也有不同的呢。以及delta SNP-index 滑窗值如何获得?
遗传统计|BSA-seq混合分组鉴定功能基因分离体分组混合分析法(Bulked Sergeant Analysis, BSA)也称为集群分离分析法或混合分组分析法,是从近等基因系分析法演变而来的。常规的育种通常从近等基...
UP主,你好,我想请问 AD_REF.SRR6327817 = ref_split[,3],
AD_ALT.SRR6327817 = alt_split[,3],
AD_REF.SRR6327818 = ref_split[,4],
AD_ALT.SRR6327818 = alt_split[,4]
这一步是什么意思,[3],[4]代表什么呢
参考:以水稻为例教你如何使用BSA方法进行遗传定位(下篇) - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com/p/0f593134ede1...