公众号：BioIT爱好者（ID: bioitee）<br><br>语雀：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fwww.yuque.com%2Fshenweiyan" target="_blank">https://www.yuque.com/shenweiyan</a>
发简信
IP属地：广东
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已毕业，抱歉不搞这个了
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SNP过滤时常用参数的解析（群体遗传）关于为何要进行SNP的过滤： 第一，低质量和无信息的SNP会影响后续群体结构或GWAS的分析结果，甚至影响后续对生物学问题的解释；第二，群体研究时，由于测序的个体较多检测出来...
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GATK入门的最佳姿势
GATK，全称是Genome Anlysis Toolkit，顾名思义，是一套用于分析基因组的工具箱。主要功能是寻找变异位点和基因分型，但是实际上功能超多，导致初学者都不知道...
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西澳大学生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因组与群体基因组学的挖掘<br><br>简信不回答问题，有问题发至<br>lakeseafly50@gmail.com
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你好，想问下，用GATK得到的SNPs后，用什么程序再次进行质量筛选，得到高质量的SNPs呢？
「简化基因组」如何过滤用GATK分析得到的SNP
GATK官方提供了一个SNP过滤的标准，howto-apply-hard-filters-to-a-call-set,如果你按照它的要求来过滤简化基因组中的SNP数据，也就是...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
