如果有25年在跑的同志们可以参考一下:igraph版本过新会导致和monocle不兼容,到cds >-orderCells(cds)这一步就会报错,后面pseudotime和state可视化跑不出来。这个时候把新版本的igraph卸载掉,加载2.0.3版本就好了
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这是一个新系列 差不多是一年以前,我定导后没多久,接手了读研后的第一个课题。合作方是医院,和我对接的是一名博一的医学生,最开始两边的老师很排斥常规的单细胞文章思路,即各大类细...
SingleR 使用SingleR包进行单细胞类型注释分析 Celaref 使用Celaref包进行单细胞类型注释分析(一):Celaref Overview and Ins...
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scCustomize:自定义可视化你的单细胞数据(一)简介 scCustomize是一个单细胞转录组数据可视化的R包,里面集合了一些常用的数据可视化方法,可以与Seurat包进行很好的联用,支持Seurat,LIGER和SCE等...
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1. A single-cell map for the transcriptomic signatures of peripheral blood mononuclear ...
好久不见!我的产假还剩一个多月,小娃娃两个半月了,天使宝宝,省爹省妈,所以我也有些时间了,陆续开始学习和备课,整理资料咯。 从Timer2.0的主页发现了一个优秀的资源: h...
初学者 推荐直接装最新版R。见https://www.bilibili.com/video/BV1J44y1R7ci/[https://www.bilibili.com/vi...
可以用options(timeout=10000)
updateR() The setup files are corrupted. Please obtain a new copy of the program问题 在安装包时warning显示该包基于R 4.3.2建立,warning太多看着烦于是想要进行更新看网上教程可用installr包的updateR函数 直接打开R(不是R...
问题 在安装包时warning显示该包基于R 4.3.2建立,warning太多看着烦于是想要进行更新看网上教程可用installr包的updateR函数 直接打开R(不是R...
由于太久没有分析过bulk数据了,前几天突然被要求分析一个文章的数据时有点乱了手脚,所以在这里想总结一下关于芯片数据与seq数据的差异分析流程。 假如你是小白,也刚刚了解NG...