这是一个新系列 差不多是一年以前,我定导后没多久,接手了读研后的第一个课题。合作方是医院,和我对接的是一名博一的医学生,最开始两边的老师很排斥常规的单细胞文章思路,即各大类细...
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SingleR 使用SingleR包进行单细胞类型注释分析 Celaref 使用Celaref包进行单细胞类型注释分析(一):Celaref Overview and Ins...
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scCustomize:自定义可视化你的单细胞数据(一)简介 scCustomize是一个单细胞转录组数据可视化的R包,里面集合了一些常用的数据可视化方法,可以与Seurat包进行很好的联用,支持Seurat,LIGER和SCE等...
简介 scCustomize是一个单细胞转录组数据可视化的R包,里面集合了一些常用的数据可视化方法,可以与Seurat包进行很好的联用,支持Seurat,LIGER和SCE等...
1. A single-cell map for the transcriptomic signatures of peripheral blood mononuclear ...
好久不见!我的产假还剩一个多月,小娃娃两个半月了,天使宝宝,省爹省妈,所以我也有些时间了,陆续开始学习和备课,整理资料咯。 从Timer2.0的主页发现了一个优秀的资源: h...
初学者 推荐直接装最新版R。见https://www.bilibili.com/video/BV1J44y1R7ci/[https://www.bilibili.com/vi...
可以用options(timeout=10000)
updateR() The setup files are corrupted. Please obtain a new copy of the program问题 在安装包时warning显示该包基于R 4.3.2建立,warning太多看着烦于是想要进行更新看网上教程可用installr包的updateR函数 直接打开R(不是R...
问题 在安装包时warning显示该包基于R 4.3.2建立,warning太多看着烦于是想要进行更新看网上教程可用installr包的updateR函数 直接打开R(不是R...
由于太久没有分析过bulk数据了,前几天突然被要求分析一个文章的数据时有点乱了手脚,所以在这里想总结一下关于芯片数据与seq数据的差异分析流程。 假如你是小白,也刚刚了解NG...
本文首发于我的个人博客[https://www.ikeguang.com/?p=1783] %>%来自dplyr包的管道函数,我们可以将其理解为车间里的流水线,经过前一步加工...
TCGA数据库中含有的癌症名称,简写和中文名称 Abbr英文名称中文名称ACCAdrenocortical carcinoma肾上腺皮质癌BLCABladder Urothe...
单细胞富集分析系列: 单细胞之富集分析-1:单细胞GSEA分析流程[https://www.jianshu.com/p/00f069cb239c] 单细胞之富集分析-2:批量...
Compiled: March 18, 2021 来源:https://satijalab.org/seurat/articles/pbmc3k_tutorial.html[...