最近在处理服务器上的R,顺便就想往服务器上装一个RStudio。因此就有了本文记录一下安装的过程。我们的服务器是CentOS 7系统,其他发行版安装过程其实也大同小异。RSt...
写在前面 其实很多作者已经探索的差不多了,相关脚本、教程也很多,但我还是自己系统的总结一下吧。有时候感觉是浪费时间,但是在写的时候能发现并学习到很多新的知识,不断记录反思,也...
ChIP-seq数据分析实战训练(二) 四、过滤 raw data -> fastqc 使用trim_galore软件进行质控,过滤 过滤后的文件如下: clean data...
ChIP-seq数据分析实战训练(三) 六、合并bam文件 在进行peaks calling的时候,需要把bam进行合并。 得到全新的bam文件如下: 假如需要去除PCR重...
ChIP-seq数据分析实战训练(一) 一、安装软件(conda) 二、下载数据 参考文献 Brookes, E. et al. Polycomb associates ge...
前言 Linux系统的基本操作,对于大多数计算机类相关学生或者相关从业人员都很重要,本文以树莓派的Linux系统为实例,从基础出发,详细介绍Linux系统中最基础的操作。 什...
有很多的生信软件都可以通过conda安装,省去了很多的安装、修bug的烦恼。经常是安装到崩溃的软件,conda一行命令就搞定了。前两天有个胖友问我gatk 3.8的版本在哪里...
1数据获得 2 格式转换 3 质控 主要是看是否有接头序列 4. 去除接头 接头序列:GATCGGAAGAGCGGTTCAGCAGGAATGCCGAG 去除完接头最好再次质控...