如何计算r^2降到0.2时的值呢?是从Out.bin.gz里面自己找值吗?
10.GWAS:LD decay(LD衰减)—— PopLDdecay关于连锁不平衡的详细介绍在之前的帖子里有说过,这里就不再赘述,本篇主要介绍LD decay的计算。1.GWAS:原理与目的 - 简书 (jianshu.com)[https:...
官方网站:https://itol.embl.de/[https://itol.embl.de/] ITOL是Interaction Tree Of Life(网址:http...
还是老习惯,给出官网教程,至于你是看还是不看,它就在那里,等着你的深入研究~ https://horvath.genetics.ucla.edu/html/Coexpress...
WGCNA分析基于两个假设:1.相似表达模式的基因可能存在共调控、功能相关或处于同一通路,2.基因网络符合无尺度分布。基于这两点,可以将基因网络根据表达相似性划分为不同的模块...
WGCNA的原理如果不掌握的话,就很难在做WGCNA分析的过程中,利用手中的代码去修改参数,就无法得到满意的图图。所以,下面放几篇文献中的WGCNA的流程图,供参考 然后放上...
致知 2019-10-06一起为你的基因找个朋友吧~ 上一次学习WGCNA还是7月份做小组作业的时候,本来想做WGCNA,但是当时各方面没有入门,理解不了这个是个啥东西,最后...
目的:对群体结构和亲缘关系进行评估以确定使用的统计模型和获得相应的矩阵 评估内容(遗传上差异过大应剔除,相似性高的保留其一) Structure是与PCA、进化树相似的方法,...