对于R语言导出的图片,有时候由于绘图细节等问题可能无法直接用于论文投稿,此时就需要借助一些图片处理软件对R语言绘制的图片进行细节调整,如颜色、字体、注释及排版等。今天...
对于R语言导出的图片,有时候由于绘图细节等问题可能无法直接用于论文投稿,此时就需要借助一些图片处理软件对R语言绘制的图片进行细节调整,如颜色、字体、注释及排版等。今天...
在ggplot2程序包的加持下,R语言可以做出非常漂亮的统计图出来。然而大家是否会有这样的体会,为了做出理想的图片,需要不停的调整作图的参数,包括颜色,字体大小,字体格式,注...
这是我第一次写简书上面的文章,为什么这一次提笔想记录一下整个下午自己遇见问题,解决问题的过程,以前都是自己解决完问题记录在有道云笔记上就OK了,今天感觉像这样的过程在以往的科...
免疫系统与肿瘤之间的关系是目前癌症领域研究最多的课题之一。以前,人们认为癌症仅肿瘤本身的作用;然而,现在我们知道它需要不同细胞和细胞因子的支持,即肿瘤微环境(TME)。在构成...
ICI:Immune Cell Infiltration, 免疫细胞浸润。GC:Gastric Cancer, 胃癌。以前看分子分型文章时,基本都是分子分型→基因分型→预后分...
看文献是经常发现有堆叠柱状图+百分比展示的例子,下面就来复现下这样的图形。下图中的C图。 以IMvigor210免疫治疗队列数据为例: 1.输入数据 输入数据rt是两个因子变...
estimate包可以通过RNA-seq的数据来计算标本的免疫及机制评分,进而评估肿瘤的纯度,其原理通过特征的肿瘤的RNA-seq的signture来评估以上内容,其输入文件...
参考文章地址(https://zhuanlan.zhihu.com/p/120422644) 逗号分隔文件(.csv文件)、制表符分隔文件(.tsv文件)和空格分隔文件(.t...
TCGA学习01:数据下载与整理 - 简书 TCGA学习02:差异分析 - 简书 TCGA学习03:生存分析 - 简书 TCGA学习04:建模预测-cox回归 - 简书...
1、读入clinical.json文件 2、初始化变量 3、利用一个for循环由json文件中提取信息 4、将提取的信息做成一个dataFrame 转自
分析基因表达量和预后的关系大体思路为:找出某一癌症中感兴趣的基因表达量和病人生存时间的数据,再进行生存分析,画图 分解起来看 第一步:得到基因表达量和病人生存时间相应的数据 ...
今天偶然从一篇paper里看到了一张R绘制的相关性图,跟以往看到的有些不一样。这张图里面不仅展示了相关系数,并且相关系数显示的大小跟相关系数是成比例的。这样做的好处是,让那些...