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前面的教程已经进行了WGCNA分析并将各个模块的网络图绘制文件导出,接下来将进行共表达网络的绘制,本次教程依旧根据PlantTech的Cytoscape课程[https://...
统计分析与可视化是R语言最强的两个点。本节简要介绍一些R基础绘图中的参数。R图形可设置的参数很多,大概可以分为以下几大部分: 图像的保存。不同类型的保存大致步骤相同,如保存为...
因为样本数量比较可观,所以可以进行WGCNA分析。这里是并不需要选取所有的基因来做WGCNA分析,挑选的标准可以是top变异程度大的基因集合,或者显著差异表达的基因集合等等。...
完整流程、注意事项、统计原理:http://blog.sciencenet.cn/blog-118204-1111379.html[http://blog.sciencene...
WGCNA分析过程中,你可以得到edge和node的文件,里面有你某一个module里所有基因相互之间的connectivity的weight值,根据这些值你可以将它们之间的...