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  • @leoxiaobei 老师,nlstools::confint2获得置信区间,只能得出一组的和difference的置信区间,另一组的置信区间应该如何获得呢?

    生物节律之cosinor分析——终极R包circacompare(5)

    前面我们已经介绍了cosinor差异分析最常用的两个包:cosinor和cosinor2包,这两个包其实已经做得非常好了,就是还有一点点缺陷,下面一起来看看它们的缺陷: 1....

  • 老师,您好。请问一下作出来的图没有显示余弦曲线,也提示 Data is arrhythmic,但是仍然给出了mesor,amplitude和peak time三个值,那这三个值还有意义吗?

    生物节律之cosinor分析——终极R包circacompare(5)

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  • @千容安 好的,谢谢老师

    基于mRNA表达表格做信号通路富集图

    KEGG Bar plot 以bar的颜色和高度体现enrichment scores(比如pvalue),gene counts或者ratio作为bar Dot plot ...

  • @千容安 请问源数据指的是org.Rn.eg.db吗?应该怎么给源数据添加SYMBOL列呢?

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    10X单细胞(10X空间转录组)做WGCNA分析的智慧

    hello,大家好,今天给大家分享一些10X单细胞(10X空间转录组)做WGCNA分析时的一些东西,个人认为很重要,不过不得不承认的是,10X单细胞(10X空间转录组)做WG...

  • 请问在做WGCNA前 基因表达矩阵 一定要先标准化吗?用 标准化的 或 未标准化的 基因表达矩阵 做WGCNA分析有什么差别吗?

    WGCNA分析

    WGCNA基本概念 加权基因共表达网络分析 (WGCNA, Weighted correlation network analysis)是用来描述不同样品之间基因关联模式的系...

  • phenotypes 是自己制作的,但是 genotypes 文件应该如何获取呢?

    PheWAS(全表型组关联分析)----PheWAS实战(三)

    介绍完PheWAS与GWAS的概念及其对比以及PheWAS的R包后,相信大家对对PheWAS原理以及相关R包有了初步认知。下面我以我做的一个项目的数据为例跑PheWAS。 1...