前言 说到富集分析,大家肯定第一时间会想到GO、KEGG、GSEA等常见的基因富集分析。那什么是基因富集分析呢?简单来说就是把我们筛选出来的基因按照先验的知识分一个类,以...
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前言 说到富集分析,大家肯定第一时间会想到GO、KEGG、GSEA等常见的基因富集分析。那什么是基因富集分析呢?简单来说就是把我们筛选出来的基因按照先验的知识分一个类,以...
@生信店小二 好滴,谢谢您!
LOLA:overlap analysis for enrichment of genomic region set前言 说到富集分析,大家肯定第一时间会想到GO、KEGG、GSEA等常见的基因富集分析。那什么是基因富集分析呢?简单来说就是把我们筛选出来的基因按照先验的知识分一个类,以...
@生信店小二 好的,十分感谢您!我还有一个问题,关于自定义数据库的架构。我有好几个自定义数据,把所有的bed文件放在一个regions目录中,还是分别建立目录放置这些数据呢?
LOLA:overlap analysis for enrichment of genomic region set前言 说到富集分析,大家肯定第一时间会想到GO、KEGG、GSEA等常见的基因富集分析。那什么是基因富集分析呢?简单来说就是把我们筛选出来的基因按照先验的知识分一个类,以...
您好,我想请问一下这三个文件userSets, userUniverse, regionDB,分别代表什么。userSets是感兴趣的(目标的)一个基因区域的合计,regionDB是一个有意义的集合。想要测试感兴趣的userSets集合是不是显著富集在regionDB中。那么userUniverse代表什么呢?
LOLA:overlap analysis for enrichment of genomic region set前言 说到富集分析,大家肯定第一时间会想到GO、KEGG、GSEA等常见的基因富集分析。那什么是基因富集分析呢?简单来说就是把我们筛选出来的基因按照先验的知识分一个类,以...
AHRD (Automated Assignment of Human Readable Descriptions ), 对基因进行注释,包括GO。 githup直戳这里 安...
我运行起来速度还行,等几秒基本都能出来结果
网页blast功能的实现,viroblast 的安装这两天在实现数据库的blast功能 。在雁栖湖的时候,实现网页blast功能是通过在服务器上安装本地blast,然后在PHP代码里面使用system函数传递参数来实现的。听师...