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主成分分析-PCA图的优化（R语言）
R语言的主成分分析（PCA）详解和带聚类的PCA图绘制 最近有个老师在整理文章数据，由于分组较多，想展示PCA图，说明不同分组的差异，公司默认给出的PCA图比较朴素，想做的好...
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如何写一封规范的Cover letter?
本文来源于微信公众号SCI狂人，版权归SCI狂人团队所有，更多资料可以关注微信公众号SCI狂人 投过了SCI期刊的小伙伴都知道，在投稿的时候需要写cover letter。如...
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数据挖掘中的LogFC,p值和FDR值是什么？GEO数据挖掘或转录组分析差异表达[https://www.plob.org/tag/%e5%b7%ae%e5%bc%82%e8%a1%a8%e8%be%be]基因时，结果中...
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跟着Nature Methods学画图：R语言画热图（pheatmap）展示基因表达量在简书 土豆学生信 分享的内容看到这篇论文 简书的链接是 https://www.jianshu.com/p/bbf9cb13b41a[https://www.jianshu...
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R beeswarm 绘制箱线、散点叠加阅读癌症基因相关文章的时候，总是会遇到类似的图： 查资料许久，看看用ggplot2当中的 geom_jitter能不能实现。但是，不幸。没有尝试成功。 然后就开始查阅资料啦 ...
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通过剪贴板在R和Excel之间移动数据相信大家都用Excel处理过数据，对于使用R的人来说，更是经常需要从Excel中把数据读入到R中做进一步处理。虽然Excel统计和绘图也很强大，但是还是是有一些局限性的。 R...
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用R来拼图和排版，告别AI和PS(一)我相信大家在看文章的时候都见过下面这样的图，这张图实际上是由5张子图经过排版而拼接起来的。 一般发文章的时候，编辑也会要求你将相关的图拼接在一起来说明同一个问题，不会让你单独...
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R语言ggplot2画带有空白格的热图之前有人在公众号留言问文章开头这幅图如何实现，下面的B图是折线图加柱形图，相对比较容易实现，上面的A图稍微有点复杂，我想到的办法是拼图，图A可以看成三个热图，然后加一个堆积柱...
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零代码差异表达分析, DESeq,limma,edgeR一网打尽
作为一个生物学家(zha)，差异表达分析似乎是一项必备的技能。然鹅对于一个没有任何编程基础的生物学家，写代码是那么神秘莫测而又遥不可及，让人脑壳疼。那么今天小编就为大家介绍一...
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推荐一份ggplot2画图的学习资料今天查资料的时候发现的，好多漂亮的图片，大部分都是借助ggplot2实现的。提供示例数据和代码。很好的R语言画图学习资料。 这份学习资料里我比较感兴趣的是以下两幅图，第一幅是...
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已经做完GO enrichment,例如david结果, ggplot2可视化有一些已经做完了GO enrichment, 得到了结果，才发现很多软件都是直接给gene list做富集。如果已经完成分析，照样可以画图，代码如下： 原始文件示例：Anno...
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Smart is the new Sexy
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傻傻分不清的：归一化(normalization)和标准化(standardization)
一、常用的特征缩放算法有两种： 归一化(normalization)和标准化(standardization) 二、归一化（normalization） 1、什么是归一化 归...
