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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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收集一些R语言相关的报错和解决方案。如果有些问题你无法处理，欢迎整理问题发送到xuzhougeng@163.com
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CentOS上由libgfortran.so.4引起的R包igraph安装问题
在R发布了3.6.1之后，我在我的CentOS服务器上编译了这个版本的R语言，随后就是开始安装各种R包。在安装clusterProfiler时，其中的一个R包igraph安装...
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本小推车专门推各种perl相关的基本语法介绍，资源，应用。特别是与生物信息学应用相关的文章。 🕛🕐🕑🕒🕓🕔🕕🕖🕗🕘🕙🕚 文章的收录是有顺序的，查看的时候请点击“最新收录”然后进行查看。 🐫 perl基本语法，比如和python语法的区别 🐫 perl上下文，比如将列表赋值给标量会发生什么 🐫 perl特殊变量，比如$_ $/ $\ 🐫 perl入门，比如循环，常见的正则使用等 🐫 perl进阶，比如引用，比如map grep等 🐫 perl高级，比如命名空间，继承，闭包等 🐫 perl的单行程序，比如与linux的各个工具搭配 🐫 perl常用模块，比如File::Basename Yaml 🐫 perl绘图，比如svg模块，GD模块，circos工具等等 🐫 perl与生物信息学之间的关系，比如用perl提取genbank 🐫 perl6的相关用法（生信不太建议学perl6） 备注：本文很多的文章也可在 JSON_NULL 的专题 『码神之路：perl篇』 中找到。这个专题对我的帮助很大，感谢这位简友
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生信~一天学会Perl，你相信吗？刘小泽开始写于19.7.31写这个是因为看到龙星教程使用了大量的perl脚本，动辄4、5千行，例如https://github.com/WGLab/PennCNV/blob/...
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转录组学习四（参考基因组及gtf注释探究）
转录组学习一（软件安装） 转录组学习二（数据下载） 转录组学习三（数据质控） 转录组学习四（参考基因组及gtf注释探究） 转录组学习五（reads的比对与samtoo...
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RNA-seq练习 第二部分（基因组序列下载，注释文件下载，索引下载，比对，比对质控,HTseq-count计数，输出count矩阵文件）参考基因组下载有三大全文网站提供参考基因组下载，它们分别是：1.NCBI （https://www.ncbi.nlm.nih.gov/grc）2.UCSC (http://h...
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2019-06-27 scenic: single-cell regulatory network inference and clustering
title：scenic: single-cell regulatory network inference and clustering journal：Nature me...
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作为生信菜鸟，虽然之前用 R 画了不少图，但经常是现用现学，感觉 R 的知识不系统，之后系统的学习一下 R 语言。在这里把读书笔记整理出来，入门书籍包括《R 语言编程艺术》、《ggplot2：数据分析与图形艺术》、《R 语言实战》、《R 语言与 Bioconductor 生物信息学应用》。
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记录数据分析过程中遇到的那些让我涨知识的坑，生信札记
