首先要知道什么是CRISPR(/ˈkrɪspər/)? 因为CRISPR是”clustered regularly interspaced short palindromic...
在分析基因组数据之前,我们首先需要关注测序的质量如何,回答下面两个问题: 测序技术错误如何分布?由何引起? 对下游分析产生如何影响? 前一节我们了解如何查看每个碱基的测序质量...
1. 下载基因组文件,ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCA/002/864/125/GCA_002864125.1_ASM28...
往期教程 「群体遗传学实战」第一课: 对SNP位点进行注释 「群体遗传学实战」第二课: 画出和文章几乎一样的PCA图 SNP位点过滤 SNP过滤有两种情况,一种是仅根据位点质...
目的:给你一个bam 文件,如何查看一个位点的碱基情况,直接IGV 就ok,如果需要看多个点,就需要使用软件了。(一般情况vcf DP4会告诉此位置ref base和非ref...
发展背景 随着ZFN、TALEN、CRISPR/Cas9等基因编辑技术的相继出现,基因编辑技术逐渐变得更加简便、 高效, 并被广泛应用于基因功能、动物模型、基因治疗等研究。但...
生信软件绕不过Perl,Perl绕不过Bioperl。而Bioperl的安装总让人头大,尤其是对普通用户。以下错误你肯定经常遇到: 这里记录尝试的过程,虽然前面几个失败了。但...
一、一代测序的结果以*.ab1和*.seq储存,其中*.seq文件可以使用记事本打开,储存的是测序的序列结果(ATCG序列,而且是峰值最高的信号所代表的碱基),而*.ab1文...