最近跑通了一遍GWAS分析,全程在linux操作,虽然具体还有好多需要微调的地方,先把代码整理分享出来mark一下 前期准备 1.理论知识 强烈推荐百迈客云课堂课程GWAS生...
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step1安装谷歌浏览器step2下载谷歌上网助手(Ghelper)http://googlehelper.net/[http://googlehelper.net/]ste...
输入文件每一列信息在哪找
使用CMplot包绘制环形曼哈度图安装并加载所需R包 基本用法 常用参数 加载并查看示例数据 基本数据格式: 前三列分别为SNP的名称,所在染色体,SNP的位置,后面每列为不同性状的P值,每个性状单独一列 默...
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大家好,本周给大家分享的是2021年12月份发表在Current biology上与中国家马体型相关主效基因突变的一篇文章。 文章题目:A single-nucleotide...
GEMMA(Genome-wide Efficient Mixed Model Association algorithm)是一款基于混合线性模型的GWAS分析软件(文献信息...
什么是直方/条形图? 直方图(Histograms)和条形图(Barchart)看起来没有什么区别,长得很像,但是这两个并不同一种统计图像。具体地,通常直方图用来描述连续型数...
频率直方图是数据统计中经常会用到的图形展示方式,同时在生物学分析中可以更好的展示表型性状的数据分布类型;R基础做图中的hist函数对单一数据的展示很方便,但是当遇到多组数据的...
1. 一代测序(Sanger sequencing) 双脱氧链终止法采用DNA复制原理。 Sanger测序反应体系中包括目标DNA片段、脱氧三磷酸核苷酸(dNTP)、双脱氧三...
PLINK语法体验 by张成龙 邮箱:yianquanwl@qq.com[mailto:yianquanwl@qq.com] 该教程参考邓飞博客与自己总结 plink软件是G...