run-featurecounts.R这些脚本的具体内容在哪里啊
RNA-seq转录组数据分析丨一套完整的案例流程今天分享的学习笔记是一套转录组分析简单流程，适用于初学者入门阅读，从原始测序数据开始，经过质控、序列比对、定量表达、差异表达、功能富集等一系列分析步骤，最终获得基因表达信息。...
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这个软件可以批量预测吗？
SOPMA--蛋白二级结构预测
▲蛋白质性质和结构分析：序列相似的蛋白质具有相似的三维结构不同蛋白质中相同的结构域（domain）具有相似的功能▲分析蛋白质的功能：一级结构：氨基酸的排列顺序；二级结构（se...
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@就是大饼 那第三类的话应该选择哪个模型呢？不指定前景枝的话它可以自己test那最后软件会告诉我它选择了谁作为前景枝了吗
hyphy计算选择压力(+pal2nal的使用)
官网：http://www.hyphy.org/[http://www.hyphy.org/]http://www.bork.embl.de/pal2nal/[http://...
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我想看我的基因树中哪些物种存在正选择且正选择位点是什么，应该选择FUBAR模型吧，这样应该是不指定foreground，那得到的文件在官网可视化的时候他也没显示哪个是他自动选择的foreground啊
Hyphy，不亚于Paml的选择压力分析的优秀软件，使用指北
近几年来，Hyphy的使用人数越来越来多，虽然不及paml，但这款软件的一些优秀特性使得它值得受到使用和关注。首先相比paml，hyphy有以下几大优点： 操作使用简单。 运...
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Hyphy，不亚于Paml的选择压力分析的优秀软件，使用指北
近几年来，Hyphy的使用人数越来越来多，虽然不及paml，但这款软件的一些优秀特性使得它值得受到使用和关注。首先相比paml，hyphy有以下几大优点： 操作使用简单。 运...
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我想看我的基因树中哪些物种存在正选择且正选择位点是什么，应该选择FUBAR模型吧，这样应该是不指定foreground，那得到的文件在官网可视化的时候他也没显示哪个是他自动选择的foreground啊
hyphy计算选择压力(+pal2nal的使用)
官网：http://www.hyphy.org/[http://www.hyphy.org/]http://www.bork.embl.de/pal2nal/[http://...
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这个软件可以不指定前景枝计算的是吧，那它计算的时候会给出我们一个适合做前景枝的一个clade吗？
Hyphy，不亚于Paml的选择压力分析的优秀软件，使用指北
近几年来，Hyphy的使用人数越来越来多，虽然不及paml，但这款软件的一些优秀特性使得它值得受到使用和关注。首先相比paml，hyphy有以下几大优点： 操作使用简单。 运...
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博主您好，在跑Iqtree时，总是报错，说要加什么安全选项，是序列过多的原因吗？
IQTREE 使用记录
什么是iqtree？ iqtree是一款构建进化树的软件，类似于phyml，raxml。文章地址：W-IQ-TREE: a fast online phylogenetic ...
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主要分享一些自己的学习过程，以菜鸟干货为主，大家有问题可以在我的博客交流(打赏也是)<br><br>
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这个工具在哪能找到呢
蛋白质的跨膜螺旋结构域预测（transmembrane helices ,TMH）
膜蛋白分析：生物膜所含的蛋白叫膜蛋白，是生物膜功能的主要承担者。生物体大约30%蛋白质都是膜蛋白，而膜蛋白是药物的主要靶标。许多膜蛋白是兼性分子，它们的多肽链可以横穿膜一次或...
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用HMM搜索和blastp分别搜索时，两个的E值应该设置成一样的吧。
基因家族分析 | 基因家族成员鉴定(hmm模型＆同源blast)
方法一：基于hmm模型的鉴定方法 1.准备数据①下载拟南芥基因组fasta文件、注释文件gtf/gff3文件：ftp://ftp.ensemblgenomes.org/pub...
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通过这个操作怎么看出来那种基因复制方式呢？
物种内共线性圈图绘制，有那么难吗？
写在前面 我受够了！整天有人问，TBtools怎么画这个图 但是我其实只想回一句： 你画这个图干什么？有什么意义？你想说谈什么生物学故事？ 承认吧，你什么都不知道，什么都没搞...
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这个共线性分析下来能看出来基因复制的类型吗
用TBtools做物种内共线性分析（仅步骤）
主要是参考https://www.tinymind.net.cn/articles/64d36abc7fd091 首先我们拿到的是以下的材料 1. Blast比对 根据以下选...
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用TBtools，快速高效实现基因组共线性分析与可视化， 赞！写在前面 对于没有做过共线性分析的小伙伴，可以通过以下几段内容，了解一下，我为什么要费劲巴拉画出这样一张图。 除了基因组成的相似性,在不同基因组中基因排列顺序的一致性更能够体...
