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methylKit是一个用于分析DNA甲基化测序数据的R包,其核心功能是差异甲基化分析和差异甲基化位点/区域的注释。 1. 加载原始数据 DNA甲基化文件格式如下: 每一行是...
了解过vcf文件的格式之后,对亲本纯合且差异的位点进行过滤就变得简单多了。如果格式规范的话一行awk命令其实就能解决。这里为了提高脚本的适用范围,所以写的稍微麻烦了些。 脚本...
前言 我在犹豫是否补充一篇怎样拆分染色体进行比对和变异检测(主要是为了提高比对和变异检测效率)的帖子。开始没有规划这篇内容的原因有两点:一是内容比较简单,觉得可能用处不大;二...
位置花斑效应PEV 某些细胞由于染色体倒位或转座,导致有些基因移至异染色质附近,导致基因沉默 eg.果蝇存在红白相间的复眼;源于同一代酵母传代后会有红白相间的菌落 机制 >w...