IP属地：天津
-
BSA分析（八）——OcBSA背景 双亲高度杂合（亲本由多个单体型构成）的分离群体利用常规的BSA分析方法往往结果并不理想，因为在混池中有多等位基因的干扰。OcBSA就通过解...
-
BSA分析（七）——DeepBSA本篇内容根据官方说明文档撰写，软件操作十分简单，所以内容不再特别详细的介绍。 DeepBSA是一种用于解析复杂性状的创新Bulked Segre...
-
vcf文件过滤亲本纯合且差异位点
了解过vcf文件的格式之后，对亲本纯合且差异的位点进行过滤就变得简单多了。如果格式规范的话一行awk命令其实就能解决。这里为了提高脚本的适用范围...
-
BSA分析（六）——QTLseqr包前言 我在犹豫是否补充一篇怎样拆分染色体进行比对和变异检测（主要是为了提高比对和变异检测效率）的帖子。开始没有规划这篇内容的原因有两点：一是内容...
-
染色体拆分VCF文件合并
本篇帖子的分享内容主要也是和前面大基因组拆分相呼应的，利用前面拆分的基因组文件，对变异检测结果文件中拆分的染色体部分进行合并，并输出最终结果。 ...
-
BSA分析（五）——变异检测及样本合并
本文中vcf文件的获取主要是使用gatk的HaplotypeCaller模块，该模块的原理大概如下： 定义active regions 沿着参考...
-
大基因组染色体拆分
脚本使用方法及参数介绍 脚本内容如下 拆分结果
-
BSA分析（四）——序列比对及比对信息统计
拿到质控后的数据就可以开始进行数据的比对了。（这里复习一下）需要确定好参考基因组，参考基因组选择标准：质量高、完整、和某一亲本相近（是亲本之一的...
-
BSA分析（三）——测序数据的质控关键词：BSA分析，测序数据质控，FastQC，Trimmomatic，去接头序列 数据格式 一定要先搞清楚数据的格式，才能进行进一步的数据整理...