SFS的基本理解、介绍的一篇文章:https://theg-cat.com/tag/joint-sfs/[https://theg-cat.com/tag/joint-sfs...
您好,请问这个地方您是如何使其名称对应上的:最终找到原因:.bed文件和.cds文件前缀要一样,ortholog命令会从.cds文件中找.bed文件里的序列名,所以两个文件的序列名字要一样,要不然就会报错。
jcvi画两物种的共线性图参考:https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version)[https://github.com/t...
参考:https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version)[https://github.com/t...
一、数据准备 首先,选取不同物种的Protein数据集:Arabidopsis_thaliana.fa;Citrus_grandis.fa;Dimocarpus_longan...
环境准备 安装软件: 参考「基因组学」使用OrthoFinder进行直系同源基因分析 安装OrthoFinder,然后再安装CAFE 数据准备: 一共会分析mouse, r...
前言:因为最近陆陆续续接手了几个物种的基因组项目,这也是生信分析中很大的一块。其中最基础的是组装和注释(当然我们实验室也做组装方法学的研究)。现在随着很多物种基因组的发表,纯...