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Adonis与ANOSIM检验究竟是什么？做微生物16S测序的时候，公司的报告里经常会给到两种检验Adonis和ANOSIM，听过t.test、wilicox、anova各种检验，那么Adonis和ANOSIM检验是...
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Gephi网络图极简教程网络分析背景知识 图是一种数据结构 图结构：是研究数据元素之间的多对多的关系。在这种结构中，任意两个元素之间可能存在关系。即结点之间的关系可以是任意的，图中任意元素之间都可能...
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Cytoscape绘制相关网络图导读 用R软件corr.test函数进行两组数组的相关性分析，用Cytoscape绘制相关网络图。 一、输入数据 代谢数据：metabo.txt 16S数据：genus.tx...
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第2篇：太空辐射诱导小鼠肠道微生物和代谢组的多模态反应
摘要： 低剂量的、不会杀死细胞的辐射处理会对病理学的临床表现造成强烈的影响，包括微生物和宿主基因表达的变化。尽管肠道微生物对维持人类身体健康的必要性已经广为人知，但是辐射对微...
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R语言ggplot2画图一套好看的配色+调整字体昨天看到的一份资料，介绍的是ggplot2画柱形图并且使用指定的字体，我感觉最终成图的配色还挺好看的，记录在这里。总共6个颜色值，分别是 c("#02B1e6", "#E81...
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R语言ggplot2画图如何获得默认的配色值之前一直有这个疑问，但是一直没有找到办法，今天看到了一个函数ggplot_build() 我们先来做一个简单的柱形图 运行 ggplot_build(p)$data 就能够获...
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R语言ggplot2分组箱线图添加误差线的简单小例子ggplot2 更改图例的顺序 箱线图添加误差线这个自己老是记不住，每次作图都得现查，今天的推文记录一下实现代码，方便自己以后查看。 首先是示例数据集 示例数据集还是使用鸢尾...
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跟着Nature Communications学作图：R语言ggplot2做柱形图并添加误差线和显著性P值论文是 A giant NLR gene confers broad-spectrum resistance to Phytophthora sojae in soybean...
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Alpha多样性【转】
Alpha多样性是指一个特定区域或生态系统内的多样性，是反映丰富度和均匀度的综合指标。Alpha多样性主要与两个因素有关：一是种类数目，即丰富度；二是多样性，群落中个体分配上...
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组间分析—T检验、R语言绘图T检验 在做微生物群落分析时经常要寻找不同群落之间的差异，我们会经常关心两个或者多个群落之间是否显著不同。就两个微生物群落间的比较，T检验是最常用的方法之一。 本次推文主要内...
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