写在前面 早些时候，TBtools中增加了唐海宝老师和王希胤老师早年的作品MCScan【注：当然事实上是MCScanX】的GUI Wrapper。这个工具事实上适用于多基因组...
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TBtools | 更灵敏但也准确的串联重复鉴定逻辑 -
矫正基因结构注释 - 做有良心的基因家族分析写在前面 半个月前，我推了一个《任何人都能掌握-基因家族分析》的腾讯课程（原本事实是开给课题组）。在热身课程（完全免费）中，将我个人对基因家族分析的认知和其意义均做了说明，感...
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windows下SRA Toolkit下载原始数据打脸时刻来了~~~~之前在Linux下用SRA Toolkit下载数据效果不好，所以，果断的将它拉入了黑名单。但是最近下载数据，用windows版本的SRA Toolkit，...
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基因家族专题(1)：基础知识与研究思路介绍
基因家族是最近比较火的一个研究话题，被称为打开生物学问题百宝箱的钥匙，接下里几周抽时间和大家简单分享一些我最近学到的东西。 基本概念介绍 基因家族（gene family），...
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西澳大学生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因组与群体基因组学的挖掘<br><br>简信不回答问题，有问题发至<br>lakeseafly50@gmail.com
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随笔 | 时时刻刻，有人在给你打分~
年轻时，一般不会明白为什么年长的总要提「态度」一词。而事实上，这就是现实。无论一个人的内心如何活动，思想如何，甚至是出发点如何，人们对他的评判最终只会基于他的行动，更或者说，...
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Batch SMART 最强序列特征[结构域]预测软件写在前面 前天，在学位论文的完善中，有两个疑似ERF成员始终令我困扰。植物转录因子中有个超家族AP2，包括两个亚家族，一个也叫AP2，另一个叫ERF。前者往往含有两个AP2结...
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如何在NCBI批量下载基因家族序列？在做生信下游基因分析的时候，我们通常需要下载兴趣基因的序列信息构建进化书什么的，如果兴趣基因比较少，那么可以直接在NCBI上搜索这个基因下载序列。但如果兴趣基因很多，如果逐个...
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基因家族分析（1）数据准备及软件安装基因组数据的准备 进行全基因水平的基因家族鉴定之前，需要准备好一套基因组数据，基因组数据可以从公共数据库下载，也可以根据基因组文献提供的地址到指定网站进行下载。一套完整的数据...
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如何使用SPDE进行基因ID的批量替换以及基因ID的批量转换最近有同学向我反映想要大规模替换基因ID实在太难。今天为大家提供SPDE的解决方案。顺便唠叨一句，SPDE是我在生信实践过程中遇到问题以及解决问题的产物，如果有些问题我觉得大...
