主要参考 祝让飞 的文章及 Tufts 网站中的信息，特此致谢。 首先放一张测序示意图，在DNA片段两端所加的序列即接头序列，也就是我们今天要讲述的主角。 1 基本概念 1....
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高通量测序中的接头（adapter）到底是什么 -
Metagenomics 宏基因组流程 学习笔记流程解析 本流程适用于二代测序Single End或Paired Enc数据。可单样本或多样本分析。 第一步：查看数据质量（Fastqc） 使用Fastqc数据质量网页报告，...
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【小工具】智能合并测序数据fastq的脚本
介绍： 这是一个可以自动合并数据的简易脚本 应用场景： 有一批数据有三十几个样本,测序公司返回数据时由于数据量不达标，需要加测一次，部分样本数据量还是不够, 又加测一次才够，...
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斑点（blob）检测一、什么是斑点？ 斑点是图像中的一组连接像素，它们共享一些共同属性（例如灰度值）。 在下图中，暗连通区域是斑点，斑点检测的目标是识别和标记这些区域。 二、简单的斑点检测器...
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TBtools与abricate综合运用：毒力基因/耐药基因热图绘制首先安装好abricate和TBtools，abricate用conda:conda install -c bioconda abricate以十株NCBI数据库中的大肠杆菌...
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[Linux] Miniconda安装及其使用
集群环境下安装conda进行软件管理。Miniconda是Anaconda的简化版，对于一般需求而言就够用了。因此，我这里安装Minconda3进行软件安装管理。 安装 Mi...
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跟着Nature Communications学数据分析：R语言做随机森林模型并对变量重要性排序论文 Drivers and trends of global soil microbial carbon over two decades https://www.natu...
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大师兄的Python机器学习笔记:特征提取大师兄的Python机器学习笔记:Pandas库 一、关于分类(Classification) 1. 什么是分类 分类是机器学习的重要模块，主要用来预测数据的类别标签。 2....
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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conda简单运用(此推送献给我的师弟师妹们）
简介 作为刚入门的生信人来说，在Linux上安装软件时件很头疼的事情，如果你学会利用conda去安装的话，事情将会简单很多！照例，文章的一开头，肯定是要介绍一下conda是什...
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高通量测序中，read、contig和Scaffold分别是什么
1.什么是Reads? 高通量测序平台产生的序列就称为reads。 2.什么是Contig？ 拼接软件基于reads之间的overlap区，拼接获得的序列称为Contig（重...
