
使用featureCounts对bam文件进行定量。
常用的参考基因组数据库: 1、Ensembl 是由European Bioinformatics Institute(EBI)与Wellcome Trust Sanger I...
Counts值 对给定的基因组参考区域,计算比对上的read数,又称为raw count(RC)。计数结果的差异的影响因素:落在参考区域上下限的read是否需要被统计,按照什...
这一部分主要是关于安装包管理软件miniconda已经miniconda的使用,在徐洲更哥哥的b站教程里有非常非常详细的讲解,跟着做几乎不会踩坑,我这里从安装minicond...
简介 PCA全称Principal Component Analysis,即主成分分析,是一种常用的数据降维方法。它可以通过线性变换将原始数据变换为一组各维度线性无关的表示,...
理解ChIP-Seq 到了目前这个水平,我学习新的高通量数据分析流程时已经不再考虑代码应该如何写的问题了。我更多要去考虑一个技术的目的和意义。 转录组主要研究的问题是基因在不...